Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
FSIP1Q8NA03 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
FSIP1Q8NA03 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
FSIP1Q8NA03 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
FSIP1Q8NA03 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
FSIP1Q8NA03 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
FSIP1Q8NA03 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
FSIP1Q8NA03 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
FSIP1Q8NA03 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
FSIP1Q8NA03 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
FSIP1Q8NA03 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
FSIP1Q8NA03 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
FSIP1Q8NA03 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
FSIP1Q8NA03 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
FSIP1Q8NA03 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
FSIP1Q8NA03 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
FSIP1Q8NA03 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
FSIP1Q8NA03 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
FSIP1Q8NA03 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
FSIP1Q8NA03 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
FSIP1Q8NA03 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
FSIP1Q8NA03 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
FSIP1Q8NA03 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
FSIP1Q8NA03 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
FSIP1Q8NA03 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
FSIP1Q8NA03 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
FSIP1Q8NA03 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
FSIP1Q8NA03 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
FSIP1Q8NA03 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
FSIP1Q8NA03 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
FSIP1Q8NA03 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
FSIP1Q8NA03 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
FSIP1Q8NA03 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
FSIP1Q8NA03 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
FSIP1Q8NA03 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
FSIP1Q8NA03 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
FSIP1Q8NA03 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
FSIP1Q8NA03 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
FSIP1Q8NA03 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
FSIP1Q8NA03 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FSIP1Q8NA03 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
FSIP1Q8NA03 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
FSIP1Q8NA03 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FSIP1Q8NA03 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
FSIP1Q8NA03 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
FSIP1Q8NA03 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
FSIP1Q8NA03 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FSIP1Q8NA03 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FSIP1Q8NA03 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FSIP1Q8NA03 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FSIP1Q8NA03 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
FSIP1Q8NA03 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FSIP1Q8NA03 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
FSIP1Q8NA03 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
FSIP1Q8NA03 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
FSIP1Q8NA03 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
FSIP1Q8NA03 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
FSIP1Q8NA03 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FSIP1Q8NA03 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
FSIP1Q8NA03 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
FSIP1Q8NA03 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
FSIP1Q8NA03 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
FSIP1Q8NA03 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
FSIP1Q8NA03 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
FSIP1Q8NA03 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
FSIP1Q8NA03 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
FSIP1Q8NA03 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
FSIP1Q8NA03 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
FSIP1Q8NA03 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
FSIP1Q8NA03 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FSIP1Q8NA03 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FSIP1Q8NA03 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
FSIP1Q8NA03 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
FSIP1Q8NA03 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
FSIP1Q8NA03 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
FSIP1Q8NA03 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
FSIP1Q8NA03 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
FSIP1Q8NA03 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
FSIP1Q8NA03 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FSIP1Q8NA03 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
FSIP1Q8NA03 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FSIP1Q8NA03 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
FSIP1Q8NA03 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
FSIP1Q8NA03 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
FSIP1Q8NA03 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
FSIP1Q8NA03 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
FSIP1Q8NA03 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
FSIP1Q8NA03 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
FSIP1Q8NA03 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
FSIP1Q8NA03 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
FSIP1Q8NA03 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
FSIP1Q8NA03 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
FSIP1Q8NA03 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FSIP1Q8NA03 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
FSIP1Q8NA03 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
FSIP1Q8NA03 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
FSIP1Q8NA03 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
FSIP1Q8NA03 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
FSIP1Q8NA03 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
FSIP1Q8NA03 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms