Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF20Q5VT98 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF20Q5VT98 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF20Q5VT98 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEF20Q5VT98 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRAMEF20Q5VT98 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRAMEF20Q5VT98 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF20Q5VT98 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF20Q5VT98 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF20Q5VT98 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF20Q5VT98 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF20Q5VT98 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF20Q5VT98 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF20Q5VT98 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF20Q5VT98 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF20Q5VT98 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF20Q5VT98 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF20Q5VT98 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF20Q5VT98 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF20Q5VT98 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF20Q5VT98 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF20Q5VT98 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF20Q5VT98 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF20Q5VT98 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF20Q5VT98 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF20Q5VT98 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF20Q5VT98 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF20Q5VT98 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF20Q5VT98 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRAMEF20Q5VT98 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF20Q5VT98 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF20Q5VT98 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAMEF20Q5VT98 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF20Q5VT98 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF20Q5VT98 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF20Q5VT98 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF20Q5VT98 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAMEF20Q5VT98 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF20Q5VT98 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF20Q5VT98 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF20Q5VT98 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAMEF20Q5VT98 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF20Q5VT98 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF20Q5VT98 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF20Q5VT98 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAMEF20Q5VT98 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF20Q5VT98 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF20Q5VT98 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF20Q5VT98 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAMEF20Q5VT98 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRAMEF20Q5VT98 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF20Q5VT98 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF20Q5VT98 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF20Q5VT98 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF20Q5VT98 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF20Q5VT98 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF20Q5VT98 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF20Q5VT98 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF20Q5VT98 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF20Q5VT98 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF20Q5VT98 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF20Q5VT98 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF20Q5VT98 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF20Q5VT98 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF20Q5VT98 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF20Q5VT98 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF20Q5VT98 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF20Q5VT98 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF20Q5VT98 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF20Q5VT98 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF20Q5VT98 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF20Q5VT98 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF20Q5VT98 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRAMEF20Q5VT98 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF20Q5VT98 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF20Q5VT98 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF20Q5VT98 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF20Q5VT98 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF20Q5VT98 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF20Q5VT98 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF20Q5VT98 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF20Q5VT98 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF20Q5VT98 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF20Q5VT98 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF20Q5VT98 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF20Q5VT98 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF20Q5VT98 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF20Q5VT98 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF20Q5VT98 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF20Q5VT98 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF20Q5VT98 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF20Q5VT98 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF20Q5VT98 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF20Q5VT98 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF20Q5VT98 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF20Q5VT98 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF20Q5VT98 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF20Q5VT98 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF20Q5VT98 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF20Q5VT98 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms