Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC181Q5TID7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC181Q5TID7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC181Q5TID7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC181Q5TID7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC181Q5TID7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC181Q5TID7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC181Q5TID7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC181Q5TID7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC181Q5TID7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms