Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCDC181Q5TID7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC181Q5TID7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC181Q5TID7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCDC181Q5TID7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC181Q5TID7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC181Q5TID7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC181Q5TID7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC181Q5TID7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC181Q5TID7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC181Q5TID7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC181Q5TID7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC181Q5TID7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC181Q5TID7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC181Q5TID7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC181Q5TID7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC181Q5TID7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC181Q5TID7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC181Q5TID7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC181Q5TID7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC181Q5TID7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC181Q5TID7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC181Q5TID7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC181Q5TID7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC181Q5TID7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC181Q5TID7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC181Q5TID7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC181Q5TID7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC181Q5TID7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC181Q5TID7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC181Q5TID7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC181Q5TID7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC181Q5TID7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC181Q5TID7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC181Q5TID7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC181Q5TID7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC181Q5TID7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC181Q5TID7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC181Q5TID7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC181Q5TID7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC181Q5TID7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC181Q5TID7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC181Q5TID7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CCDC181Q5TID7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CCDC181Q5TID7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCDC181Q5TID7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC181Q5TID7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC181Q5TID7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC181Q5TID7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC181Q5TID7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC181Q5TID7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC181Q5TID7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC181Q5TID7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC181Q5TID7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC181Q5TID7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC181Q5TID7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC181Q5TID7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC181Q5TID7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC181Q5TID7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC181Q5TID7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC181Q5TID7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC181Q5TID7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC181Q5TID7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC181Q5TID7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC181Q5TID7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC181Q5TID7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC181Q5TID7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC181Q5TID7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC181Q5TID7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC181Q5TID7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC181Q5TID7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC181Q5TID7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC181Q5TID7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC181Q5TID7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC181Q5TID7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC181Q5TID7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC181Q5TID7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC181Q5TID7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC181Q5TID7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC181Q5TID7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC181Q5TID7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC181Q5TID7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC181Q5TID7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC181Q5TID7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC181Q5TID7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC181Q5TID7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC181Q5TID7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC181Q5TID7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC181Q5TID7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC181Q5TID7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC181Q5TID7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC181Q5TID7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC181Q5TID7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC181Q5TID7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC181Q5TID7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC181Q5TID7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC181Q5TID7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC181Q5TID7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC181Q5TID7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC181Q5TID7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms