Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRTP1Q5TC63 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRTP1Q5TC63 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRTP1Q5TC63 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRTP1Q5TC63 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRTP1Q5TC63 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRTP1Q5TC63 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRTP1Q5TC63 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRTP1Q5TC63 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRTP1Q5TC63 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRTP1Q5TC63 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRTP1Q5TC63 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRTP1Q5TC63 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRTP1Q5TC63 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRTP1Q5TC63 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRTP1Q5TC63 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRTP1Q5TC63 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRTP1Q5TC63 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GRTP1Q5TC63 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRTP1Q5TC63 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRTP1Q5TC63 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRTP1Q5TC63 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRTP1Q5TC63 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRTP1Q5TC63 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRTP1Q5TC63 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRTP1Q5TC63 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRTP1Q5TC63 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRTP1Q5TC63 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GRTP1Q5TC63 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRTP1Q5TC63 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRTP1Q5TC63 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRTP1Q5TC63 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRTP1Q5TC63 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRTP1Q5TC63 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRTP1Q5TC63 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRTP1Q5TC63 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRTP1Q5TC63 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRTP1Q5TC63 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRTP1Q5TC63 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRTP1Q5TC63 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRTP1Q5TC63 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRTP1Q5TC63 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRTP1Q5TC63 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRTP1Q5TC63 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRTP1Q5TC63 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRTP1Q5TC63 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRTP1Q5TC63 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRTP1Q5TC63 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRTP1Q5TC63 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRTP1Q5TC63 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRTP1Q5TC63 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRTP1Q5TC63 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRTP1Q5TC63 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRTP1Q5TC63 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GRTP1Q5TC63 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GRTP1Q5TC63 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRTP1Q5TC63 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRTP1Q5TC63 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRTP1Q5TC63 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRTP1Q5TC63 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRTP1Q5TC63 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRTP1Q5TC63 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRTP1Q5TC63 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRTP1Q5TC63 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRTP1Q5TC63 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRTP1Q5TC63 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRTP1Q5TC63 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRTP1Q5TC63 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRTP1Q5TC63 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRTP1Q5TC63 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRTP1Q5TC63 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRTP1Q5TC63 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms