Protein–RNA interactions for Protein: Q01664

TFAP4, Transcription factor AP-4, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP4Q01664 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TFAP4Q01664 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TFAP4Q01664 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TFAP4Q01664 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TFAP4Q01664 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TFAP4Q01664 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TFAP4Q01664 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TFAP4Q01664 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TFAP4Q01664 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TFAP4Q01664 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TFAP4Q01664 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TFAP4Q01664 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TFAP4Q01664 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TFAP4Q01664 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TFAP4Q01664 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TFAP4Q01664 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TFAP4Q01664 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TFAP4Q01664 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TFAP4Q01664 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TFAP4Q01664 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TFAP4Q01664 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TFAP4Q01664 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TFAP4Q01664 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TFAP4Q01664 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
TFAP4Q01664 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TFAP4Q01664 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
TFAP4Q01664 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
TFAP4Q01664 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TFAP4Q01664 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TFAP4Q01664 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TFAP4Q01664 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TFAP4Q01664 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
TFAP4Q01664 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TFAP4Q01664 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TFAP4Q01664 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
TFAP4Q01664 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TFAP4Q01664 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TFAP4Q01664 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TFAP4Q01664 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TFAP4Q01664 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TFAP4Q01664 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TFAP4Q01664 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TFAP4Q01664 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TFAP4Q01664 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TFAP4Q01664 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TFAP4Q01664 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TFAP4Q01664 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TFAP4Q01664 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TFAP4Q01664 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TFAP4Q01664 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TFAP4Q01664 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TFAP4Q01664 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TFAP4Q01664 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TFAP4Q01664 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TFAP4Q01664 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TFAP4Q01664 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TFAP4Q01664 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TFAP4Q01664 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TFAP4Q01664 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TFAP4Q01664 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TFAP4Q01664 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TFAP4Q01664 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TFAP4Q01664 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TFAP4Q01664 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TFAP4Q01664 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
TFAP4Q01664 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TFAP4Q01664 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TFAP4Q01664 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TFAP4Q01664 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TFAP4Q01664 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
TFAP4Q01664 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TFAP4Q01664 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TFAP4Q01664 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TFAP4Q01664 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TFAP4Q01664 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TFAP4Q01664 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TFAP4Q01664 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TFAP4Q01664 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TFAP4Q01664 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TFAP4Q01664 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TFAP4Q01664 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TFAP4Q01664 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TFAP4Q01664 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TFAP4Q01664 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TFAP4Q01664 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
TFAP4Q01664 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TFAP4Q01664 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TFAP4Q01664 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TFAP4Q01664 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TFAP4Q01664 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TFAP4Q01664 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TFAP4Q01664 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TFAP4Q01664 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TFAP4Q01664 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TFAP4Q01664 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TFAP4Q01664 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
TFAP4Q01664 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TFAP4Q01664 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TFAP4Q01664 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TFAP4Q01664 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms