Protein–RNA interactions for Protein: Q01664

TFAP4, Transcription factor AP-4, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP4Q01664 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.58■■■■■ 4.09
TFAP4Q01664 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
TFAP4Q01664 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
TFAP4Q01664 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
TFAP4Q01664 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
TFAP4Q01664 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
TFAP4Q01664 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TFAP4Q01664 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
TFAP4Q01664 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TFAP4Q01664 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
TFAP4Q01664 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TFAP4Q01664 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
TFAP4Q01664 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TFAP4Q01664 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TFAP4Q01664 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
TFAP4Q01664 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TFAP4Q01664 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TFAP4Q01664 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TFAP4Q01664 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
TFAP4Q01664 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TFAP4Q01664 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TFAP4Q01664 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TFAP4Q01664 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TFAP4Q01664 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TFAP4Q01664 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TFAP4Q01664 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TFAP4Q01664 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TFAP4Q01664 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TFAP4Q01664 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TFAP4Q01664 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TFAP4Q01664 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TFAP4Q01664 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TFAP4Q01664 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TFAP4Q01664 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TFAP4Q01664 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TFAP4Q01664 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TFAP4Q01664 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TFAP4Q01664 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TFAP4Q01664 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TFAP4Q01664 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TFAP4Q01664 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TFAP4Q01664 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TFAP4Q01664 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TFAP4Q01664 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TFAP4Q01664 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
TFAP4Q01664 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TFAP4Q01664 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TFAP4Q01664 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TFAP4Q01664 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TFAP4Q01664 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TFAP4Q01664 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TFAP4Q01664 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
TFAP4Q01664 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TFAP4Q01664 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TFAP4Q01664 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TFAP4Q01664 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TFAP4Q01664 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TFAP4Q01664 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
TFAP4Q01664 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TFAP4Q01664 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TFAP4Q01664 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TFAP4Q01664 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TFAP4Q01664 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TFAP4Q01664 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TFAP4Q01664 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TFAP4Q01664 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TFAP4Q01664 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TFAP4Q01664 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TFAP4Q01664 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TFAP4Q01664 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
TFAP4Q01664 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TFAP4Q01664 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TFAP4Q01664 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TFAP4Q01664 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TFAP4Q01664 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TFAP4Q01664 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TFAP4Q01664 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
TFAP4Q01664 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TFAP4Q01664 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TFAP4Q01664 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
TFAP4Q01664 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TFAP4Q01664 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TFAP4Q01664 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
TFAP4Q01664 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TFAP4Q01664 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TFAP4Q01664 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TFAP4Q01664 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TFAP4Q01664 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TFAP4Q01664 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TFAP4Q01664 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TFAP4Q01664 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TFAP4Q01664 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TFAP4Q01664 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TFAP4Q01664 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TFAP4Q01664 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TFAP4Q01664 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TFAP4Q01664 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TFAP4Q01664 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TFAP4Q01664 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TFAP4Q01664 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms