Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF9Q00978 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF9Q00978 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF9Q00978 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF9Q00978 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF9Q00978 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF9Q00978 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF9Q00978 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF9Q00978 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF9Q00978 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF9Q00978 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF9Q00978 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF9Q00978 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRF9Q00978 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF9Q00978 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
IRF9Q00978 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF9Q00978 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF9Q00978 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF9Q00978 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF9Q00978 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF9Q00978 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF9Q00978 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF9Q00978 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF9Q00978 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRF9Q00978 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRF9Q00978 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRF9Q00978 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRF9Q00978 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRF9Q00978 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRF9Q00978 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF9Q00978 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF9Q00978 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF9Q00978 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF9Q00978 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF9Q00978 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IRF9Q00978 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRF9Q00978 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF9Q00978 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF9Q00978 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF9Q00978 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF9Q00978 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF9Q00978 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms