Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTG2P63267 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTG2P63267 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTG2P63267 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTG2P63267 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTG2P63267 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTG2P63267 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTG2P63267 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTG2P63267 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTG2P63267 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTG2P63267 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTG2P63267 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTG2P63267 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTG2P63267 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTG2P63267 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTG2P63267 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTG2P63267 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTG2P63267 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTG2P63267 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTG2P63267 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTG2P63267 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTG2P63267 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTG2P63267 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTG2P63267 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTG2P63267 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTG2P63267 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTG2P63267 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTG2P63267 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTG2P63267 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTG2P63267 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTG2P63267 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTG2P63267 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTG2P63267 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTG2P63267 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTG2P63267 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTG2P63267 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTG2P63267 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTG2P63267 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTG2P63267 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTG2P63267 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTG2P63267 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTG2P63267 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTG2P63267 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTG2P63267 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTG2P63267 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTG2P63267 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTG2P63267 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTG2P63267 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTG2P63267 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTG2P63267 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTG2P63267 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTG2P63267 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTG2P63267 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTG2P63267 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTG2P63267 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTG2P63267 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTG2P63267 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTG2P63267 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTG2P63267 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTG2P63267 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTG2P63267 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTG2P63267 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTG2P63267 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTG2P63267 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTG2P63267 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTG2P63267 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms