Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POU3F4P49335 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POU3F4P49335 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POU3F4P49335 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POU3F4P49335 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POU3F4P49335 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POU3F4P49335 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POU3F4P49335 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POU3F4P49335 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POU3F4P49335 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU3F4P49335 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POU3F4P49335 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU3F4P49335 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU3F4P49335 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU3F4P49335 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POU3F4P49335 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
POU3F4P49335 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
POU3F4P49335 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POU3F4P49335 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POU3F4P49335 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POU3F4P49335 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POU3F4P49335 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POU3F4P49335 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POU3F4P49335 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POU3F4P49335 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POU3F4P49335 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU3F4P49335 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU3F4P49335 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU3F4P49335 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU3F4P49335 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU3F4P49335 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU3F4P49335 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU3F4P49335 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU3F4P49335 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU3F4P49335 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms