Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MAGEA4P43358 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MAGEA4P43358 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MAGEA4P43358 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MAGEA4P43358 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MAGEA4P43358 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MAGEA4P43358 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MAGEA4P43358 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MAGEA4P43358 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MAGEA4P43358 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MAGEA4P43358 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MAGEA4P43358 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MAGEA4P43358 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MAGEA4P43358 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MAGEA4P43358 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MAGEA4P43358 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MAGEA4P43358 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MAGEA4P43358 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MAGEA4P43358 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MAGEA4P43358 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAGEA4P43358 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAGEA4P43358 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAGEA4P43358 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MAGEA4P43358 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MAGEA4P43358 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MAGEA4P43358 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MAGEA4P43358 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MAGEA4P43358 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MAGEA4P43358 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAGEA4P43358 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAGEA4P43358 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MAGEA4P43358 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAGEA4P43358 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAGEA4P43358 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAGEA4P43358 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MAGEA4P43358 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MAGEA4P43358 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MAGEA4P43358 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MAGEA4P43358 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MAGEA4P43358 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAGEA4P43358 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAGEA4P43358 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MAGEA4P43358 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MAGEA4P43358 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MAGEA4P43358 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MAGEA4P43358 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MAGEA4P43358 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MAGEA4P43358 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MAGEA4P43358 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MAGEA4P43358 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MAGEA4P43358 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MAGEA4P43358 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MAGEA4P43358 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MAGEA4P43358 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MAGEA4P43358 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MAGEA4P43358 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MAGEA4P43358 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MAGEA4P43358 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MAGEA4P43358 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MAGEA4P43358 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MAGEA4P43358 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MAGEA4P43358 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MAGEA4P43358 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MAGEA4P43358 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MAGEA4P43358 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MAGEA4P43358 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MAGEA4P43358 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MAGEA4P43358 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MAGEA4P43358 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MAGEA4P43358 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MAGEA4P43358 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAGEA4P43358 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAGEA4P43358 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MAGEA4P43358 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MAGEA4P43358 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MAGEA4P43358 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MAGEA4P43358 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MAGEA4P43358 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MAGEA4P43358 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MAGEA4P43358 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MAGEA4P43358 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MAGEA4P43358 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAGEA4P43358 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MAGEA4P43358 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MAGEA4P43358 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MAGEA4P43358 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MAGEA4P43358 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAGEA4P43358 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAGEA4P43358 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAGEA4P43358 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAGEA4P43358 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAGEA4P43358 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAGEA4P43358 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAGEA4P43358 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAGEA4P43358 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAGEA4P43358 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAGEA4P43358 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MAGEA4P43358 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAGEA4P43358 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MAGEA4P43358 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms