Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYLC1P35663 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYLC1P35663 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYLC1P35663 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYLC1P35663 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYLC1P35663 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYLC1P35663 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYLC1P35663 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYLC1P35663 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYLC1P35663 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYLC1P35663 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYLC1P35663 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.58■■■□□ 2
CYLC1P35663 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CYLC1P35663 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CYLC1P35663 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CYLC1P35663 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CYLC1P35663 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CYLC1P35663 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CYLC1P35663 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CYLC1P35663 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CYLC1P35663 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CYLC1P35663 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CYLC1P35663 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CYLC1P35663 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CYLC1P35663 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CYLC1P35663 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CYLC1P35663 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CYLC1P35663 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CYLC1P35663 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYLC1P35663 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYLC1P35663 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYLC1P35663 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYLC1P35663 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYLC1P35663 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYLC1P35663 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYLC1P35663 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYLC1P35663 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CYLC1P35663 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYLC1P35663 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYLC1P35663 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYLC1P35663 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYLC1P35663 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYLC1P35663 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYLC1P35663 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYLC1P35663 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYLC1P35663 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYLC1P35663 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CYLC1P35663 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYLC1P35663 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYLC1P35663 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYLC1P35663 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYLC1P35663 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CYLC1P35663 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYLC1P35663 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYLC1P35663 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYLC1P35663 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYLC1P35663 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYLC1P35663 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYLC1P35663 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYLC1P35663 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYLC1P35663 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYLC1P35663 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYLC1P35663 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYLC1P35663 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYLC1P35663 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYLC1P35663 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYLC1P35663 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYLC1P35663 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CYLC1P35663 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CYLC1P35663 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYLC1P35663 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYLC1P35663 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYLC1P35663 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYLC1P35663 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYLC1P35663 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYLC1P35663 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYLC1P35663 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYLC1P35663 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYLC1P35663 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYLC1P35663 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYLC1P35663 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CYLC1P35663 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CYLC1P35663 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYLC1P35663 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYLC1P35663 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYLC1P35663 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYLC1P35663 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYLC1P35663 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYLC1P35663 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYLC1P35663 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYLC1P35663 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYLC1P35663 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYLC1P35663 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYLC1P35663 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYLC1P35663 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYLC1P35663 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYLC1P35663 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYLC1P35663 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYLC1P35663 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYLC1P35663 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms