Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP1A3P13637 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP1A3P13637 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP1A3P13637 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP1A3P13637 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP1A3P13637 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP1A3P13637 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP1A3P13637 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP1A3P13637 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP1A3P13637 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP1A3P13637 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP1A3P13637 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP1A3P13637 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP1A3P13637 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP1A3P13637 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP1A3P13637 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP1A3P13637 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP1A3P13637 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP1A3P13637 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP1A3P13637 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP1A3P13637 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP1A3P13637 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP1A3P13637 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP1A3P13637 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP1A3P13637 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP1A3P13637 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP1A3P13637 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP1A3P13637 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP1A3P13637 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP1A3P13637 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP1A3P13637 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP1A3P13637 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP1A3P13637 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP1A3P13637 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP1A3P13637 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP1A3P13637 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP1A3P13637 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP1A3P13637 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP1A3P13637 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP1A3P13637 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP1A3P13637 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP1A3P13637 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP1A3P13637 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP1A3P13637 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP1A3P13637 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP1A3P13637 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP1A3P13637 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP1A3P13637 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP1A3P13637 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP1A3P13637 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP1A3P13637 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP1A3P13637 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP1A3P13637 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP1A3P13637 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP1A3P13637 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP1A3P13637 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP1A3P13637 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATP1A3P13637 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP1A3P13637 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP1A3P13637 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP1A3P13637 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP1A3P13637 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP1A3P13637 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP1A3P13637 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP1A3P13637 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP1A3P13637 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP1A3P13637 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP1A3P13637 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP1A3P13637 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP1A3P13637 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP1A3P13637 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP1A3P13637 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP1A3P13637 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP1A3P13637 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP1A3P13637 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP1A3P13637 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP1A3P13637 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP1A3P13637 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP1A3P13637 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP1A3P13637 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP1A3P13637 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP1A3P13637 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP1A3P13637 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP1A3P13637 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP1A3P13637 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP1A3P13637 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP1A3P13637 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP1A3P13637 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP1A3P13637 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP1A3P13637 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP1A3P13637 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP1A3P13637 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP1A3P13637 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP1A3P13637 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP1A3P13637 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP1A3P13637 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP1A3P13637 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP1A3P13637 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP1A3P13637 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP1A3P13637 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms