Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ATP1A3P13637 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
ATP1A3P13637 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ATP1A3P13637 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ATP1A3P13637 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ATP1A3P13637 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
ATP1A3P13637 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ATP1A3P13637 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ATP1A3P13637 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
ATP1A3P13637 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ATP1A3P13637 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ATP1A3P13637 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ATP1A3P13637 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ATP1A3P13637 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ATP1A3P13637 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ATP1A3P13637 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ATP1A3P13637 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ATP1A3P13637 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ATP1A3P13637 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ATP1A3P13637 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ATP1A3P13637 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
ATP1A3P13637 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ATP1A3P13637 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ATP1A3P13637 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ATP1A3P13637 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ATP1A3P13637 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ATP1A3P13637 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ATP1A3P13637 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATP1A3P13637 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP1A3P13637 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ATP1A3P13637 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATP1A3P13637 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ATP1A3P13637 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
ATP1A3P13637 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ATP1A3P13637 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ATP1A3P13637 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ATP1A3P13637 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ATP1A3P13637 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ATP1A3P13637 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ATP1A3P13637 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATP1A3P13637 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ATP1A3P13637 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATP1A3P13637 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ATP1A3P13637 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ATP1A3P13637 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ATP1A3P13637 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATP1A3P13637 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATP1A3P13637 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATP1A3P13637 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATP1A3P13637 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATP1A3P13637 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP1A3P13637 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATP1A3P13637 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATP1A3P13637 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ATP1A3P13637 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ATP1A3P13637 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
ATP1A3P13637 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ATP1A3P13637 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ATP1A3P13637 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
ATP1A3P13637 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ATP1A3P13637 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ATP1A3P13637 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ATP1A3P13637 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ATP1A3P13637 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ATP1A3P13637 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ATP1A3P13637 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ATP1A3P13637 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ATP1A3P13637 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ATP1A3P13637 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ATP1A3P13637 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ATP1A3P13637 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ATP1A3P13637 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ATP1A3P13637 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ATP1A3P13637 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ATP1A3P13637 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ATP1A3P13637 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATP1A3P13637 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATP1A3P13637 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATP1A3P13637 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ATP1A3P13637 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ATP1A3P13637 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATP1A3P13637 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ATP1A3P13637 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATP1A3P13637 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATP1A3P13637 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ATP1A3P13637 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ATP1A3P13637 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ATP1A3P13637 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP1A3P13637 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP1A3P13637 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP1A3P13637 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP1A3P13637 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP1A3P13637 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP1A3P13637 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP1A3P13637 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP1A3P13637 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATP1A3P13637 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATP1A3P13637 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATP1A3P13637 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ATP1A3P13637 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms