Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL6A2P12110 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL6A2P12110 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL6A2P12110 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL6A2P12110 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL6A2P12110 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL6A2P12110 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
COL6A2P12110 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL6A2P12110 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL6A2P12110 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL6A2P12110 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL6A2P12110 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL6A2P12110 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL6A2P12110 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL6A2P12110 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL6A2P12110 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
COL6A2P12110 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL6A2P12110 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL6A2P12110 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL6A2P12110 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
COL6A2P12110 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL6A2P12110 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL6A2P12110 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL6A2P12110 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL6A2P12110 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL6A2P12110 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL6A2P12110 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL6A2P12110 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL6A2P12110 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL6A2P12110 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL6A2P12110 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL6A2P12110 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL6A2P12110 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL6A2P12110 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL6A2P12110 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL6A2P12110 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL6A2P12110 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL6A2P12110 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL6A2P12110 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL6A2P12110 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL6A2P12110 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL6A2P12110 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL6A2P12110 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL6A2P12110 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COL6A2P12110 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL6A2P12110 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL6A2P12110 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL6A2P12110 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL6A2P12110 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL6A2P12110 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL6A2P12110 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL6A2P12110 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL6A2P12110 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL6A2P12110 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL6A2P12110 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL6A2P12110 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL6A2P12110 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL6A2P12110 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL6A2P12110 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL6A2P12110 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL6A2P12110 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL6A2P12110 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COL6A2P12110 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL6A2P12110 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
COL6A2P12110 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL6A2P12110 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL6A2P12110 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL6A2P12110 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms