Protein–RNA interactions for Protein: P08579

SNRPB2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPB2P08579 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRPB2P08579 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRPB2P08579 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRPB2P08579 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRPB2P08579 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRPB2P08579 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRPB2P08579 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRPB2P08579 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRPB2P08579 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRPB2P08579 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRPB2P08579 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRPB2P08579 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPB2P08579 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPB2P08579 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPB2P08579 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPB2P08579 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPB2P08579 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPB2P08579 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPB2P08579 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPB2P08579 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPB2P08579 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPB2P08579 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPB2P08579 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPB2P08579 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRPB2P08579 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRPB2P08579 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRPB2P08579 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPB2P08579 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPB2P08579 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPB2P08579 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPB2P08579 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPB2P08579 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPB2P08579 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPB2P08579 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPB2P08579 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPB2P08579 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPB2P08579 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPB2P08579 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRPB2P08579 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRPB2P08579 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRPB2P08579 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRPB2P08579 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRPB2P08579 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRPB2P08579 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRPB2P08579 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRPB2P08579 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNRPB2P08579 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNRPB2P08579 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNRPB2P08579 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNRPB2P08579 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNRPB2P08579 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRPB2P08579 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPB2P08579 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms