Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HMBSP08397 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HMBSP08397 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HMBSP08397 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HMBSP08397 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HMBSP08397 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HMBSP08397 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HMBSP08397 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HMBSP08397 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HMBSP08397 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HMBSP08397 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HMBSP08397 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HMBSP08397 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HMBSP08397 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HMBSP08397 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HMBSP08397 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMBSP08397 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMBSP08397 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMBSP08397 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMBSP08397 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMBSP08397 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMBSP08397 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMBSP08397 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMBSP08397 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMBSP08397 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HMBSP08397 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HMBSP08397 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HMBSP08397 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HMBSP08397 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMBSP08397 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMBSP08397 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMBSP08397 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMBSP08397 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMBSP08397 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMBSP08397 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMBSP08397 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMBSP08397 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMBSP08397 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMBSP08397 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMBSP08397 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMBSP08397 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMBSP08397 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMBSP08397 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMBSP08397 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMBSP08397 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMBSP08397 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HMBSP08397 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMBSP08397 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMBSP08397 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMBSP08397 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HMBSP08397 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HMBSP08397 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HMBSP08397 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HMBSP08397 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HMBSP08397 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMBSP08397 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMBSP08397 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMBSP08397 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMBSP08397 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMBSP08397 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMBSP08397 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HMBSP08397 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HMBSP08397 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMBSP08397 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMBSP08397 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMBSP08397 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMBSP08397 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMBSP08397 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMBSP08397 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMBSP08397 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMBSP08397 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMBSP08397 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMBSP08397 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMBSP08397 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HMBSP08397 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMBSP08397 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMBSP08397 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMBSP08397 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMBSP08397 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMBSP08397 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMBSP08397 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HMBSP08397 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HMBSP08397 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HMBSP08397 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HMBSP08397 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HMBSP08397 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HMBSP08397 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HMBSP08397 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HMBSP08397 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HMBSP08397 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
HMBSP08397 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMBSP08397 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMBSP08397 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HMBSP08397 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMBSP08397 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HMBSP08397 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HMBSP08397 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HMBSP08397 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMBSP08397 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMBSP08397 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms