Protein–RNA interactions for Protein: O95935

TBX18, T-box transcription factor TBX18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX18O95935 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TBX18O95935 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TBX18O95935 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TBX18O95935 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TBX18O95935 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TBX18O95935 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TBX18O95935 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TBX18O95935 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TBX18O95935 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TBX18O95935 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TBX18O95935 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TBX18O95935 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TBX18O95935 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TBX18O95935 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TBX18O95935 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TBX18O95935 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TBX18O95935 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TBX18O95935 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TBX18O95935 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TBX18O95935 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TBX18O95935 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TBX18O95935 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TBX18O95935 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TBX18O95935 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TBX18O95935 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TBX18O95935 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TBX18O95935 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TBX18O95935 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TBX18O95935 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TBX18O95935 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TBX18O95935 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TBX18O95935 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TBX18O95935 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TBX18O95935 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TBX18O95935 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TBX18O95935 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TBX18O95935 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TBX18O95935 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TBX18O95935 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TBX18O95935 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TBX18O95935 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TBX18O95935 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TBX18O95935 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TBX18O95935 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TBX18O95935 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TBX18O95935 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TBX18O95935 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TBX18O95935 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TBX18O95935 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TBX18O95935 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TBX18O95935 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TBX18O95935 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TBX18O95935 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TBX18O95935 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TBX18O95935 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TBX18O95935 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TBX18O95935 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TBX18O95935 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TBX18O95935 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TBX18O95935 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TBX18O95935 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TBX18O95935 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
TBX18O95935 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TBX18O95935 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TBX18O95935 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TBX18O95935 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TBX18O95935 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TBX18O95935 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TBX18O95935 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TBX18O95935 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TBX18O95935 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TBX18O95935 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TBX18O95935 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TBX18O95935 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TBX18O95935 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TBX18O95935 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TBX18O95935 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TBX18O95935 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TBX18O95935 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TBX18O95935 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TBX18O95935 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TBX18O95935 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TBX18O95935 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TBX18O95935 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TBX18O95935 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TBX18O95935 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TBX18O95935 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TBX18O95935 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TBX18O95935 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TBX18O95935 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TBX18O95935 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TBX18O95935 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TBX18O95935 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TBX18O95935 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TBX18O95935 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TBX18O95935 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TBX18O95935 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TBX18O95935 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TBX18O95935 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TBX18O95935 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms