Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRKAB2O43741 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRKAB2O43741 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRKAB2O43741 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRKAB2O43741 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRKAB2O43741 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRKAB2O43741 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRKAB2O43741 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
PRKAB2O43741 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRKAB2O43741 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRKAB2O43741 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRKAB2O43741 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRKAB2O43741 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRKAB2O43741 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRKAB2O43741 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRKAB2O43741 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRKAB2O43741 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRKAB2O43741 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRKAB2O43741 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRKAB2O43741 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRKAB2O43741 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRKAB2O43741 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRKAB2O43741 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PRKAB2O43741 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PRKAB2O43741 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRKAB2O43741 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRKAB2O43741 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRKAB2O43741 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRKAB2O43741 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PRKAB2O43741 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRKAB2O43741 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRKAB2O43741 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRKAB2O43741 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRKAB2O43741 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRKAB2O43741 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRKAB2O43741 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRKAB2O43741 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRKAB2O43741 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRKAB2O43741 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRKAB2O43741 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRKAB2O43741 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
PRKAB2O43741 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRKAB2O43741 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRKAB2O43741 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRKAB2O43741 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRKAB2O43741 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRKAB2O43741 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRKAB2O43741 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
PRKAB2O43741 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PRKAB2O43741 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRKAB2O43741 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRKAB2O43741 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRKAB2O43741 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRKAB2O43741 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRKAB2O43741 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRKAB2O43741 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRKAB2O43741 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRKAB2O43741 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PRKAB2O43741 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PRKAB2O43741 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PRKAB2O43741 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRKAB2O43741 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRKAB2O43741 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRKAB2O43741 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PRKAB2O43741 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PRKAB2O43741 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRKAB2O43741 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRKAB2O43741 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRKAB2O43741 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PRKAB2O43741 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRKAB2O43741 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRKAB2O43741 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PRKAB2O43741 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRKAB2O43741 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRKAB2O43741 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRKAB2O43741 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRKAB2O43741 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRKAB2O43741 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRKAB2O43741 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRKAB2O43741 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRKAB2O43741 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PRKAB2O43741 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRKAB2O43741 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRKAB2O43741 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRKAB2O43741 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRKAB2O43741 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRKAB2O43741 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRKAB2O43741 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRKAB2O43741 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRKAB2O43741 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRKAB2O43741 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRKAB2O43741 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRKAB2O43741 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRKAB2O43741 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRKAB2O43741 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRKAB2O43741 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRKAB2O43741 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRKAB2O43741 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PRKAB2O43741 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRKAB2O43741 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms