Protein–RNA interactions for Protein: O14521

SDHD, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHDO14521 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDHDO14521 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDHDO14521 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDHDO14521 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDHDO14521 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDHDO14521 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDHDO14521 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDHDO14521 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDHDO14521 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDHDO14521 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDHDO14521 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDHDO14521 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SDHDO14521 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDHDO14521 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDHDO14521 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDHDO14521 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDHDO14521 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDHDO14521 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDHDO14521 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDHDO14521 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDHDO14521 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDHDO14521 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDHDO14521 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDHDO14521 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDHDO14521 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDHDO14521 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SDHDO14521 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDHDO14521 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDHDO14521 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDHDO14521 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SDHDO14521 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDHDO14521 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDHDO14521 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDHDO14521 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDHDO14521 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDHDO14521 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDHDO14521 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDHDO14521 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDHDO14521 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDHDO14521 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDHDO14521 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDHDO14521 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDHDO14521 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDHDO14521 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDHDO14521 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDHDO14521 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDHDO14521 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDHDO14521 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SDHDO14521 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDHDO14521 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDHDO14521 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDHDO14521 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDHDO14521 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDHDO14521 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDHDO14521 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDHDO14521 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDHDO14521 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDHDO14521 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDHDO14521 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDHDO14521 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDHDO14521 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDHDO14521 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDHDO14521 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDHDO14521 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDHDO14521 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDHDO14521 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDHDO14521 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDHDO14521 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDHDO14521 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDHDO14521 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDHDO14521 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDHDO14521 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDHDO14521 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDHDO14521 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDHDO14521 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDHDO14521 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SDHDO14521 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SDHDO14521 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SDHDO14521 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SDHDO14521 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SDHDO14521 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDHDO14521 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDHDO14521 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDHDO14521 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDHDO14521 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDHDO14521 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDHDO14521 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDHDO14521 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDHDO14521 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SDHDO14521 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDHDO14521 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDHDO14521 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDHDO14521 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDHDO14521 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDHDO14521 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDHDO14521 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDHDO14521 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDHDO14521 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDHDO14521 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SDHDO14521 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms