Protein–RNA interactions for Protein: O14521

SDHD, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHDO14521 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SDHDO14521 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SDHDO14521 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SDHDO14521 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SDHDO14521 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SDHDO14521 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
SDHDO14521 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SDHDO14521 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SDHDO14521 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SDHDO14521 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SDHDO14521 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SDHDO14521 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
SDHDO14521 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SDHDO14521 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SDHDO14521 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SDHDO14521 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SDHDO14521 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
SDHDO14521 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SDHDO14521 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SDHDO14521 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SDHDO14521 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SDHDO14521 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SDHDO14521 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SDHDO14521 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SDHDO14521 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SDHDO14521 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SDHDO14521 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SDHDO14521 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SDHDO14521 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SDHDO14521 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SDHDO14521 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SDHDO14521 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SDHDO14521 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SDHDO14521 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SDHDO14521 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SDHDO14521 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SDHDO14521 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SDHDO14521 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SDHDO14521 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SDHDO14521 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SDHDO14521 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SDHDO14521 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SDHDO14521 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SDHDO14521 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SDHDO14521 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SDHDO14521 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SDHDO14521 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SDHDO14521 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SDHDO14521 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SDHDO14521 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SDHDO14521 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SDHDO14521 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SDHDO14521 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SDHDO14521 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SDHDO14521 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SDHDO14521 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SDHDO14521 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SDHDO14521 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SDHDO14521 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SDHDO14521 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SDHDO14521 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SDHDO14521 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SDHDO14521 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SDHDO14521 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SDHDO14521 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SDHDO14521 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SDHDO14521 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SDHDO14521 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SDHDO14521 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SDHDO14521 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SDHDO14521 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SDHDO14521 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SDHDO14521 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SDHDO14521 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SDHDO14521 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SDHDO14521 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SDHDO14521 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SDHDO14521 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SDHDO14521 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SDHDO14521 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SDHDO14521 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SDHDO14521 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SDHDO14521 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SDHDO14521 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SDHDO14521 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SDHDO14521 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SDHDO14521 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SDHDO14521 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SDHDO14521 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SDHDO14521 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SDHDO14521 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SDHDO14521 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SDHDO14521 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SDHDO14521 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SDHDO14521 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SDHDO14521 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SDHDO14521 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SDHDO14521 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SDHDO14521 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SDHDO14521 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms