Protein–RNA interactions for Protein: O00499

BIN1, Myc box-dependent-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN1O00499 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BIN1O00499 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BIN1O00499 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BIN1O00499 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BIN1O00499 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BIN1O00499 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BIN1O00499 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
BIN1O00499 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BIN1O00499 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BIN1O00499 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BIN1O00499 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BIN1O00499 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BIN1O00499 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
BIN1O00499 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BIN1O00499 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BIN1O00499 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BIN1O00499 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BIN1O00499 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BIN1O00499 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BIN1O00499 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BIN1O00499 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BIN1O00499 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BIN1O00499 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BIN1O00499 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BIN1O00499 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BIN1O00499 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BIN1O00499 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BIN1O00499 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BIN1O00499 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BIN1O00499 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BIN1O00499 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
BIN1O00499 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BIN1O00499 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BIN1O00499 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BIN1O00499 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BIN1O00499 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BIN1O00499 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BIN1O00499 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BIN1O00499 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BIN1O00499 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BIN1O00499 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BIN1O00499 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BIN1O00499 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BIN1O00499 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BIN1O00499 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BIN1O00499 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BIN1O00499 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BIN1O00499 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BIN1O00499 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BIN1O00499 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BIN1O00499 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
BIN1O00499 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BIN1O00499 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BIN1O00499 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BIN1O00499 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BIN1O00499 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BIN1O00499 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BIN1O00499 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BIN1O00499 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BIN1O00499 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BIN1O00499 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BIN1O00499 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BIN1O00499 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BIN1O00499 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BIN1O00499 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BIN1O00499 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BIN1O00499 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BIN1O00499 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BIN1O00499 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BIN1O00499 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BIN1O00499 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BIN1O00499 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
BIN1O00499 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BIN1O00499 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BIN1O00499 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BIN1O00499 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BIN1O00499 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BIN1O00499 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BIN1O00499 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BIN1O00499 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BIN1O00499 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BIN1O00499 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BIN1O00499 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BIN1O00499 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BIN1O00499 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BIN1O00499 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BIN1O00499 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BIN1O00499 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BIN1O00499 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BIN1O00499 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BIN1O00499 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BIN1O00499 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BIN1O00499 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BIN1O00499 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BIN1O00499 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BIN1O00499 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BIN1O00499 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
BIN1O00499 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BIN1O00499 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BIN1O00499 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms