Protein–RNA interactions for Protein: O00311

CDC7, Cell division cycle 7-related protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC7O00311 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC7O00311 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC7O00311 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC7O00311 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC7O00311 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC7O00311 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDC7O00311 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC7O00311 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC7O00311 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC7O00311 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC7O00311 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC7O00311 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC7O00311 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC7O00311 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC7O00311 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC7O00311 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC7O00311 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC7O00311 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC7O00311 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC7O00311 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC7O00311 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC7O00311 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC7O00311 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC7O00311 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC7O00311 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC7O00311 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC7O00311 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC7O00311 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC7O00311 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC7O00311 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC7O00311 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDC7O00311 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDC7O00311 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC7O00311 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC7O00311 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC7O00311 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC7O00311 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC7O00311 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC7O00311 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC7O00311 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC7O00311 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC7O00311 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC7O00311 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC7O00311 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC7O00311 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC7O00311 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC7O00311 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC7O00311 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC7O00311 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC7O00311 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC7O00311 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC7O00311 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC7O00311 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC7O00311 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDC7O00311 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC7O00311 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC7O00311 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC7O00311 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC7O00311 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC7O00311 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC7O00311 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC7O00311 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC7O00311 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC7O00311 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC7O00311 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC7O00311 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC7O00311 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC7O00311 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC7O00311 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC7O00311 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC7O00311 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC7O00311 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC7O00311 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC7O00311 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC7O00311 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC7O00311 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC7O00311 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC7O00311 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDC7O00311 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC7O00311 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC7O00311 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC7O00311 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC7O00311 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC7O00311 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC7O00311 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC7O00311 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC7O00311 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC7O00311 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC7O00311 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC7O00311 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC7O00311 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC7O00311 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC7O00311 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC7O00311 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC7O00311 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC7O00311 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC7O00311 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC7O00311 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC7O00311 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDC7O00311 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms