RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355415.6

MFSD12-201, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 12, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MFSD12, Length 2,124 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD12-201ENST00000355415 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.06■■■■■ 6.57
MFSD12-201ENST00000355415 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.63■■■■■ 5.37
MFSD12-201ENST00000355415 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.1■■■■■ 5.13
MFSD12-201ENST00000355415 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.59■■■■■ 5.05
MFSD12-201ENST00000355415 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.25■■■■■ 4.99
MFSD12-201ENST00000355415 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.14■■■■■ 4.98
MFSD12-201ENST00000355415 ABCC9O60706 1549 aa46.04■■■■■ 4.96
MFSD12-201ENST00000355415 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.6■■■■■ 4.89
MFSD12-201ENST00000355415 NACADO15069 1562 aa45.32■■■■■ 4.85
MFSD12-201ENST00000355415 SCRIBQ14160 1630 aa44.93■■■■■ 4.78
MFSD12-201ENST00000355415 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.9■■■■■ 4.78
MFSD12-201ENST00000355415 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.57■■■■■ 4.73
MFSD12-201ENST00000355415 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.94■■■■■ 4.62
MFSD12-201ENST00000355415 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.65■■■■■ 4.58
MFSD12-201ENST00000355415 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.62■■■■■ 4.57
MFSD12-201ENST00000355415 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.58■■■■■ 4.57
MFSD12-201ENST00000355415 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.53■■■■■ 4.56
MFSD12-201ENST00000355415 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.36■■■■■ 4.53
MFSD12-201ENST00000355415 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.26■■■■■ 4.52
MFSD12-201ENST00000355415 SMARCA4P51532 1647 aa43.01■■■■■ 4.48
MFSD12-201ENST00000355415 WIZO95785 1651 aa43■■■■■ 4.47
MFSD12-201ENST00000355415 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.68■■■■■ 4.42
MFSD12-201ENST00000355415 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.4
MFSD12-201ENST00000355415 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.42■■■■■ 4.38
MFSD12-201ENST00000355415 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.31■■■■■ 4.36
MFSD12-201ENST00000355415 SMARCA2P51531 1590 aa42.24■■■■■ 4.35
MFSD12-201ENST00000355415 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
MFSD12-201ENST00000355415 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.18■■■■■ 4.34
MFSD12-201ENST00000355415 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
MFSD12-201ENST00000355415 NCAPD3P42695 1498 aa41.88■■■■■ 4.29
MFSD12-201ENST00000355415 TRIM41Q8WV44 630 aa41.84■■■■■ 4.29
MFSD12-201ENST00000355415 HMGXB3Q12766 1538 aa41.77■■■■■ 4.28
MFSD12-201ENST00000355415 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.57■■■■■ 4.25
MFSD12-201ENST00000355415 ABCC8Q09428 1581 aa41.37■■■■■ 4.21
MFSD12-201ENST00000355415 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.16■■■■■ 4.18
MFSD12-201ENST00000355415 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.16■■■■■ 4.18
MFSD12-201ENST00000355415 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.09■■■■■ 4.17
MFSD12-201ENST00000355415 CFTRP13569 1480 aa41.04■■■■■ 4.16
MFSD12-201ENST00000355415 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.89■■■■■ 4.14
MFSD12-201ENST00000355415 HRCP23327 699 aa40.85■■■■■ 4.13
MFSD12-201ENST00000355415 SYNJ1O43426 1573 aa40.84■■■■■ 4.13
MFSD12-201ENST00000355415 PCGF6Q9BYE7 350 aa40.77■■■■■ 4.12
MFSD12-201ENST00000355415 SOGA1O94964 1423 aa40.7■■■■■ 4.11
MFSD12-201ENST00000355415 PRDM2Q13029 1718 aa40.66■■■■■ 4.1
MFSD12-201ENST00000355415 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.65■■■■■ 4.1
MFSD12-201ENST00000355415 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.64■■■■■ 4.1
MFSD12-201ENST00000355415 TOP2BQ02880 1626 aa40.63■■■■■ 4.1
MFSD12-201ENST00000355415 EEA1Q15075 1411 aa40.56■■■■■ 4.08
MFSD12-201ENST00000355415 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.53■■■■■ 4.08
MFSD12-201ENST00000355415 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.52■■■■■ 4.08
MFSD12-201ENST00000355415 CUX1P39880 1505 aa40.51■■■■■ 4.08
MFSD12-201ENST00000355415 NESP48681 1621 aa40.47■■■■■ 4.07
MFSD12-201ENST00000355415 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.47■■■■■ 4.07
MFSD12-201ENST00000355415 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.43■■■■■ 4.06
MFSD12-201ENST00000355415 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.38■■■■■ 4.05
MFSD12-201ENST00000355415 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
MFSD12-201ENST00000355415 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.16■■■■■ 4.02
MFSD12-201ENST00000355415 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.13■■■■■ 4.01
MFSD12-201ENST00000355415 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
MFSD12-201ENST00000355415 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.05■■■■■ 4
MFSD12-201ENST00000355415 GOLGA3Q08378 1498 aa40.05■■■■■ 4
MFSD12-201ENST00000355415 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.03■■■■■ 4
MFSD12-201ENST00000355415 KIF27Q86VH2 1401 aa40.03■■■■■ 4
MFSD12-201ENST00000355415 TNIKQ9UKE5 1360 aa40■■■■□ 3.99
MFSD12-201ENST00000355415 TOPBP1Q92547 1522 aa39.99■■■■□ 3.99
MFSD12-201ENST00000355415 KIF21BO75037 1637 aa39.97■■■■□ 3.99
MFSD12-201ENST00000355415 CUX2O14529 1486 aa39.88■■■■□ 3.98
MFSD12-201ENST00000355415 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.88■■■■□ 3.97
MFSD12-201ENST00000355415 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.88■■■■□ 3.97
MFSD12-201ENST00000355415 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.83■■■■□ 3.97
MFSD12-201ENST00000355415 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.83■■■■□ 3.97
MFSD12-201ENST00000355415 CEP162Q5TB80 1403 aa39.81■■■■□ 3.96
MFSD12-201ENST00000355415 PRXQ9BXM0 1461 aa39.77■■■■□ 3.96
MFSD12-201ENST00000355415 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.75■■■■□ 3.95
MFSD12-201ENST00000355415 IGF1RP08069 1367 aa39.68■■■■□ 3.94
MFSD12-201ENST00000355415 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.67■■■■□ 3.94
MFSD12-201ENST00000355415 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.67■■■■□ 3.94
MFSD12-201ENST00000355415 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
MFSD12-201ENST00000355415 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.58■■■■□ 3.93
MFSD12-201ENST00000355415 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP39.56■■■■□ 3.92
MFSD12-201ENST00000355415 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.5■■■■□ 3.91
MFSD12-201ENST00000355415 CLIP1P30622 1438 aa39.47■■■■□ 3.91
MFSD12-201ENST00000355415 ERCC6Q03468 1493 aa39.46■■■■□ 3.91
MFSD12-201ENST00000355415 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.43■■■■□ 3.9
MFSD12-201ENST00000355415 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
MFSD12-201ENST00000355415 WDR97A6NE52 1622 aa39.4■■■■□ 3.9
MFSD12-201ENST00000355415 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.31■■■■□ 3.88
MFSD12-201ENST00000355415 WDR62O43379 1518 aa39.31■■■■□ 3.88
MFSD12-201ENST00000355415 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.29■■■■□ 3.88
MFSD12-201ENST00000355415 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.26■■■■□ 3.88
MFSD12-201ENST00000355415 CUL7Q14999 1698 aa39.2■■■■□ 3.87
MFSD12-201ENST00000355415 IFT140Q96RY7 1462 aa39.14■■■■□ 3.86
MFSD12-201ENST00000355415 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.11■■■■□ 3.85
MFSD12-201ENST00000355415 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.11■■■■□ 3.85
MFSD12-201ENST00000355415 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.09■■■■□ 3.855e-8■■■■■ 27
MFSD12-201ENST00000355415 ARAP1Q96P48 1450 aa38.98■■■■□ 3.83
MFSD12-201ENST00000355415 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.98■■■■□ 3.83
MFSD12-201ENST00000355415 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.96■■■■□ 3.83
MFSD12-201ENST00000355415 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.93■■■■□ 3.82
MFSD12-201ENST00000355415 PBRM1Q86U86 1689 aa38.93■■■■□ 3.82
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