Protein–RNA interactions for Protein: O00299

CLIC1, Chloride intracellular channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC1O00299 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIC1O00299 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIC1O00299 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLIC1O00299 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLIC1O00299 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLIC1O00299 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIC1O00299 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIC1O00299 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIC1O00299 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIC1O00299 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIC1O00299 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIC1O00299 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIC1O00299 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC1O00299 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC1O00299 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC1O00299 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC1O00299 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC1O00299 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC1O00299 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC1O00299 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC1O00299 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC1O00299 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC1O00299 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC1O00299 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC1O00299 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC1O00299 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC1O00299 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC1O00299 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC1O00299 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC1O00299 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC1O00299 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC1O00299 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC1O00299 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC1O00299 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIC1O00299 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIC1O00299 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIC1O00299 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIC1O00299 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIC1O00299 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIC1O00299 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIC1O00299 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLIC1O00299 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLIC1O00299 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLIC1O00299 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLIC1O00299 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLIC1O00299 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLIC1O00299 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLIC1O00299 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLIC1O00299 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLIC1O00299 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIC1O00299 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIC1O00299 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIC1O00299 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIC1O00299 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIC1O00299 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIC1O00299 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIC1O00299 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLIC1O00299 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIC1O00299 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIC1O00299 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIC1O00299 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIC1O00299 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLIC1O00299 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLIC1O00299 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIC1O00299 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIC1O00299 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIC1O00299 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIC1O00299 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIC1O00299 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIC1O00299 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.2 ms