Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRDCB7Z8K6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRDCB7Z8K6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRDCB7Z8K6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRDCB7Z8K6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRDCB7Z8K6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRDCB7Z8K6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRDCB7Z8K6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRDCB7Z8K6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDCB7Z8K6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDCB7Z8K6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDCB7Z8K6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRDCB7Z8K6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRDCB7Z8K6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRDCB7Z8K6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRDCB7Z8K6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRDCB7Z8K6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRDCB7Z8K6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDCB7Z8K6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDCB7Z8K6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDCB7Z8K6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDCB7Z8K6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRDCB7Z8K6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRDCB7Z8K6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRDCB7Z8K6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRDCB7Z8K6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRDCB7Z8K6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRDCB7Z8K6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRDCB7Z8K6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRDCB7Z8K6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRDCB7Z8K6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRDCB7Z8K6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TRDCB7Z8K6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRDCB7Z8K6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRDCB7Z8K6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRDCB7Z8K6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRDCB7Z8K6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRDCB7Z8K6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRDCB7Z8K6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRDCB7Z8K6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRDCB7Z8K6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRDCB7Z8K6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRDCB7Z8K6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRDCB7Z8K6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRDCB7Z8K6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRDCB7Z8K6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRDCB7Z8K6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRDCB7Z8K6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRDCB7Z8K6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRDCB7Z8K6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRDCB7Z8K6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRDCB7Z8K6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRDCB7Z8K6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRDCB7Z8K6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRDCB7Z8K6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRDCB7Z8K6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRDCB7Z8K6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRDCB7Z8K6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRDCB7Z8K6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms