Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF879B4DU55 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF879B4DU55 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF879B4DU55 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF879B4DU55 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF879B4DU55 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF879B4DU55 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF879B4DU55 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF879B4DU55 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF879B4DU55 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF879B4DU55 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF879B4DU55 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF879B4DU55 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF879B4DU55 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF879B4DU55 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF879B4DU55 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF879B4DU55 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF879B4DU55 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF879B4DU55 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF879B4DU55 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF879B4DU55 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF879B4DU55 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF879B4DU55 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF879B4DU55 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF879B4DU55 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF879B4DU55 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF879B4DU55 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF879B4DU55 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF879B4DU55 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF879B4DU55 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF879B4DU55 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF879B4DU55 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF879B4DU55 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF879B4DU55 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF879B4DU55 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF879B4DU55 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF879B4DU55 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF879B4DU55 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF879B4DU55 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF879B4DU55 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF879B4DU55 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF879B4DU55 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF879B4DU55 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF879B4DU55 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF879B4DU55 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF879B4DU55 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF879B4DU55 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF879B4DU55 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF879B4DU55 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF879B4DU55 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF879B4DU55 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF879B4DU55 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF879B4DU55 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF879B4DU55 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF879B4DU55 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF879B4DU55 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF879B4DU55 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF879B4DU55 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms