Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NOTOA8MTQ0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOTOA8MTQ0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NOTOA8MTQ0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOTOA8MTQ0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOTOA8MTQ0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NOTOA8MTQ0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOTOA8MTQ0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOTOA8MTQ0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOTOA8MTQ0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NOTOA8MTQ0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOTOA8MTQ0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOTOA8MTQ0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOTOA8MTQ0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOTOA8MTQ0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOTOA8MTQ0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NOTOA8MTQ0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NOTOA8MTQ0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOTOA8MTQ0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOTOA8MTQ0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NOTOA8MTQ0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOTOA8MTQ0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOTOA8MTQ0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOTOA8MTQ0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOTOA8MTQ0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NOTOA8MTQ0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOTOA8MTQ0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOTOA8MTQ0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOTOA8MTQ0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOTOA8MTQ0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOTOA8MTQ0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOTOA8MTQ0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOTOA8MTQ0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOTOA8MTQ0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOTOA8MTQ0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOTOA8MTQ0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOTOA8MTQ0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOTOA8MTQ0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOTOA8MTQ0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOTOA8MTQ0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOTOA8MTQ0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOTOA8MTQ0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOTOA8MTQ0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOTOA8MTQ0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOTOA8MTQ0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOTOA8MTQ0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOTOA8MTQ0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOTOA8MTQ0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NOTOA8MTQ0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOTOA8MTQ0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOTOA8MTQ0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOTOA8MTQ0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOTOA8MTQ0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOTOA8MTQ0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOTOA8MTQ0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOTOA8MTQ0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOTOA8MTQ0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOTOA8MTQ0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOTOA8MTQ0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms