Protein–RNA interactions for Protein: A6NKX4

SLC22A31, Putative solute carrier family 22 member 31, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A31A6NKX4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC22A31A6NKX4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A31A6NKX4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A31A6NKX4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC22A31A6NKX4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC22A31A6NKX4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A31A6NKX4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A31A6NKX4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A31A6NKX4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC22A31A6NKX4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A31A6NKX4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A31A6NKX4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC22A31A6NKX4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC22A31A6NKX4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC22A31A6NKX4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC22A31A6NKX4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC22A31A6NKX4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC22A31A6NKX4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC22A31A6NKX4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC22A31A6NKX4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC22A31A6NKX4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC22A31A6NKX4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC22A31A6NKX4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC22A31A6NKX4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC22A31A6NKX4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A31A6NKX4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A31A6NKX4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A31A6NKX4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A31A6NKX4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A31A6NKX4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A31A6NKX4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A31A6NKX4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A31A6NKX4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A31A6NKX4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A31A6NKX4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A31A6NKX4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A31A6NKX4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A31A6NKX4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A31A6NKX4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC22A31A6NKX4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC22A31A6NKX4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A31A6NKX4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A31A6NKX4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A31A6NKX4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A31A6NKX4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A31A6NKX4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC22A31A6NKX4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC22A31A6NKX4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC22A31A6NKX4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A31A6NKX4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A31A6NKX4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A31A6NKX4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A31A6NKX4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A31A6NKX4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A31A6NKX4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A31A6NKX4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A31A6NKX4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A31A6NKX4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A31A6NKX4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A31A6NKX4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A31A6NKX4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A31A6NKX4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A31A6NKX4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A31A6NKX4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A31A6NKX4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A31A6NKX4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A31A6NKX4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A31A6NKX4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A31A6NKX4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A31A6NKX4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A31A6NKX4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A31A6NKX4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1493.5 ms