Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACOD1A6NK06 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACOD1A6NK06 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACOD1A6NK06 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACOD1A6NK06 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACOD1A6NK06 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACOD1A6NK06 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACOD1A6NK06 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACOD1A6NK06 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACOD1A6NK06 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACOD1A6NK06 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACOD1A6NK06 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACOD1A6NK06 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACOD1A6NK06 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACOD1A6NK06 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACOD1A6NK06 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACOD1A6NK06 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACOD1A6NK06 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACOD1A6NK06 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACOD1A6NK06 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACOD1A6NK06 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACOD1A6NK06 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACOD1A6NK06 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACOD1A6NK06 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACOD1A6NK06 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms