Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.239e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 TLE3-209ENST00000557919 4294 ntTSL 515.53■□□□□ 0.089e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.049e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 TLE3-221ENST00000560525 3647 ntTSL 514.73□□□□□ -0.059e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.089e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 TLE3-225ENST00000561453 3719 ntTSL 514.25□□□□□ -0.139e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.179e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 TLE3-213ENST00000558379 2304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.339e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.399e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 XPO1-218ENST00000476585 342 ntTSL 23.64□□□□□ -1.832e-19■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 AZIN1-207ENST00000520402 660 ntTSL 412.62□□□□□ -0.392e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 AZIN1-202ENST00000347770 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.851e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 AZIN1-203ENST00000517581 576 ntTSL 48.74□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 AZIN1-206ENST00000518940 574 ntTSL 38.12□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 AZIN1-204ENST00000518353 773 ntTSL 56.52□□□□□ -1.372e-7■■■■■ 37.6
EFTUD2Q15029 CD151-216ENST00000530155 493 ntTSL 418.53■□□□□ 0.569e-7■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 CD151-219ENST00000531999 580 ntTSL 315.3■□□□□ 0.049e-7■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 CD151-208ENST00000525868 541 ntTSL 415.19■□□□□ 0.029e-7■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 WDR77-203ENST00000459665 637 ntTSL 311.6□□□□□ -0.552e-14■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.083e-9■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 ATXN2L-211ENST00000563314 4574 ntTSL 515.41■□□□□ 0.063e-9■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.043e-9■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.073e-9■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.183e-9■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.183e-9■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.233e-9■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.313e-9■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 SLC25A1-204ENST00000468824 307 ntTSL 226.36■■□□□ 1.814e-8■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 DENND4B-213ENST00000531748 544 ntTSL 417.96■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 DENND4B-203ENST00000462423 783 ntTSL 417.3■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 DENND4B-208ENST00000480340 2530 ntTSL 214.49□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 DENND4B-211ENST00000492898 951 ntTSL 511.82□□□□□ -0.522e-8■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 DENND4B-206ENST00000474386 455 ntTSL 311.17□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 SBF1-203ENST00000399627 811 ntTSL 517.66■□□□□ 0.422e-9■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.462e-7■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.327e-7■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 PNKP-220ENST00000627232 1530 ntTSL 522.72■■□□□ 1.237e-7■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 PNKP-203ENST00000593946 1723 ntTSL 1 (best)21.03■□□□□ 0.967e-7■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.867e-7■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.847e-7■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.67e-7■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.527e-7■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 PNKP-204ENST00000594661 2111 ntTSL 215.64■□□□□ 0.097e-7■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 PNKP-221ENST00000627317 767 ntTSL 514.4□□□□□ -0.17e-7■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.32e-11■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.222e-11■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11e-6■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.792e-6■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 POMT2-211ENST00000555710 575 ntTSL 414.71□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 INAVA-201ENST00000367342 4298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 BTN3A1-211ENST00000513047 895 ntTSL 311.83□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 PPP1R13B-212ENST00000556325 546 ntTSL 510.72□□□□□ -0.691e-6■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.22e-6■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 SLC25A11-204ENST00000574710 2176 ntTSL 222.4■■□□□ 1.182e-6■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 SLC25A11-205ENST00000576951 893 ntTSL 512.26□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 UBE2D3-212ENST00000502563 680 ntTSL 310.32□□□□□ -0.766e-8■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.417e-7■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.777e-7■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 KRT18-206ENST00000549078 2088 ntTSL 519.52■□□□□ 0.727e-7■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.677e-7■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 TROAP-203ENST00000546735 1213 ntTSL 1 (best)13.31□□□□□ -0.283e-10■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 TROAP-211ENST00000549891 932 ntTSL 1 (best)12.61□□□□□ -0.393e-10■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 TROAP-214ENST00000551192 1469 ntTSL 210.84□□□□□ -0.673e-10■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 IPO4-210ENST00000559635 492 ntTSL 313.51□□□□□ -0.259e-7■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 IGDCC3-204ENST00000559231 748 ntTSL 313.92□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 37.5
EFTUD2Q15029 AKAP1-214ENST00000575032 570 ntTSL 314.12□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 NME3-203ENST00000563367 891 ntTSL 327.01■■□□□ 1.916e-11■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 NME3-208ENST00000565379 911 ntTSL 225.34■■□□□ 1.656e-11■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 NME3-202ENST00000561637 1014 ntTSL 223.8■■□□□ 1.46e-11■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 NME3-206ENST00000564252 599 ntTSL 222.18■■□□□ 1.146e-11■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 NME3-210ENST00000567271 752 ntTSL 220.8■□□□□ 0.926e-11■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 NME3-207ENST00000564628 811 ntTSL 518.08■□□□□ 0.486e-11■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 NME3-205ENST00000563854 583 ntTSL 516.59■□□□□ 0.256e-11■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 NME3-211ENST00000568561 813 ntTSL 1 (best)14.34□□□□□ -0.116e-11■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.134e-6■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 STAM-201ENST00000377500 729 ntTSL 513.66□□□□□ -0.224e-6■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 TUBA1C-206ENST00000549818 536 ntTSL 49.36□□□□□ -0.913e-36■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 CTSB-203ENST00000420692 2230 ntTSL 216.91■□□□□ 0.36e-10■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 CTSB-218ENST00000530624 430 ntTSL 513.63□□□□□ -0.236e-10■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 THOC6-210ENST00000576143 960 ntTSL 321.14■□□□□ 0.972e-7■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 THOC6-205ENST00000573704 991 ntTSL 521.14■□□□□ 0.972e-7■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 HMBS-208ENST00000536813 507 ntTSL 315.35■□□□□ 0.057e-10■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 HMBS-218ENST00000543821 562 ntTSL 411.96□□□□□ -0.497e-10■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 CIRBP-238ENST00000592412 532 ntTSL 416.85■□□□□ 0.295e-19■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 CIRBP-244ENST00000593283 758 ntTSL 516.73■□□□□ 0.275e-19■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 RFK-204ENST00000479197 1501 ntTSL 1 (best)17.53■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 RFK-202ENST00000472900 753 ntTSL 316.81■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 RFC5-202ENST00000420967 559 ntTSL 315.39■□□□□ 0.053e-12■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.033e-12■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 RFC5-206ENST00000484086 631 ntTSL 413.49□□□□□ -0.253e-12■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 RFC5-201ENST00000392542 2449 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.353e-12■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 RFC5-207ENST00000535092 574 ntTSL 411.64□□□□□ -0.553e-12■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 RFC5-208ENST00000537315 820 ntTSL 411.4□□□□□ -0.583e-12■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 RFK-206ENST00000490113 2386 ntTSL 29.92□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 RFC5-203ENST00000449641 572 ntTSL 46.69□□□□□ -1.343e-12■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 SLC2A4RG-202ENST00000473157 991 ntTSL 316.99■□□□□ 0.317e-16■■■■■ 37.4
EFTUD2Q15029 DPH1-205ENST00000570867 2265 ntTSL 220.07■□□□□ 0.87e-8■■■■■ 37.4
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