RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563367.1

NME3-203, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 3

Gene NME3, Length 891 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-203ENST00000563367 NISCHQ9Y2I1 1504 aa69.28■■■■■ 8.68
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NME3-203ENST00000563367 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa58.18■■■■■ 6.9
NME3-203ENST00000563367 NACADO15069 1562 aa58.05■■■■■ 6.88
NME3-203ENST00000563367 DCAF8L2P0C7V8 631 aa58■■■■■ 6.88
NME3-203ENST00000563367 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP57.66■■■■■ 6.82
NME3-203ENST00000563367 MYO15BQ96JP2 1530 aa57.59■■■■■ 6.81
NME3-203ENST00000563367 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa57.27■■■■■ 6.76
NME3-203ENST00000563367 UNC13AQ9UPW8 1703 aa57.04■■■■■ 6.72
NME3-203ENST00000563367 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.65■■■■■ 6.66
NME3-203ENST00000563367 BICRAQ9NZM4 1560 aa56.52■■■■■ 6.64
NME3-203ENST00000563367 SCRIBQ14160 1630 aa56.33■■■■■ 6.61
NME3-203ENST00000563367 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.96■■■■■ 6.55
NME3-203ENST00000563367 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.74■■■■■ 6.51
NME3-203ENST00000563367 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP55■■■■■ 6.39
NME3-203ENST00000563367 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.87■■■■■ 6.37
NME3-203ENST00000563367 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.48■■■■■ 6.31
NME3-203ENST00000563367 SMARCA4P51532 1647 aa53.84■■■■■ 6.21
NME3-203ENST00000563367 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP53.69■■■■■ 6.19
NME3-203ENST00000563367 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa53.58■■■■■ 6.17
NME3-203ENST00000563367 NCAPD3P42695 1498 aa53.58■■■■■ 6.17
NME3-203ENST00000563367 SMARCA2P51531 1590 aa53.48■■■■■ 6.15
NME3-203ENST00000563367 MROH2BQ7Z745 1585 aa53.44■■■■■ 6.14
NME3-203ENST00000563367 PEG3Q9GZU2 1588 aa53.29■■■■■ 6.12
NME3-203ENST00000563367 HMGXB3Q12766 1538 aa53.27■■■■■ 6.12
NME3-203ENST00000563367 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP53.11■■■■■ 6.09
NME3-203ENST00000563367 WIZO95785 1651 aa52.89■■■■■ 6.06
NME3-203ENST00000563367 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP52.7■■■■■ 6.03
NME3-203ENST00000563367 NESP48681 1621 aa52.44■■■■■ 5.99
NME3-203ENST00000563367 ERCC6Q03468 1493 aa52.23■■■■■ 5.95
NME3-203ENST00000563367 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP52.22■■■■■ 5.95
NME3-203ENST00000563367 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa52.2■■■■■ 5.95
NME3-203ENST00000563367 CADPSQ9ULU8 1353 aa51.99■■■■■ 5.91
NME3-203ENST00000563367 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.84■■■■■ 5.89
NME3-203ENST00000563367 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.82■■■■■ 5.89
NME3-203ENST00000563367 CUX2O14529 1486 aa51.75■■■■■ 5.88
NME3-203ENST00000563367 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.68■■■■■ 5.86
NME3-203ENST00000563367 CCDC88BA6NC98 1476 aa51.64■■■■■ 5.86
NME3-203ENST00000563367 CFTRP13569 1480 aa51.64■■■■■ 5.86
NME3-203ENST00000563367 FANCD2Q9BXW9 1451 aa51.41■■■■■ 5.82
NME3-203ENST00000563367 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.35■■■■■ 5.81
NME3-203ENST00000563367 MRC2Q9UBG0 1479 aa51.34■■■■■ 5.81
NME3-203ENST00000563367 PRDM2Q13029 1718 aa51.33■■■■■ 5.81
NME3-203ENST00000563367 WDR62O43379 1518 aa51.2■■■■■ 5.79
NME3-203ENST00000563367 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.19■■■■■ 5.79
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NME3-203ENST00000563367 TOPBP1Q92547 1522 aa50.58■■■■■ 5.69
NME3-203ENST00000563367 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.51■■■■■ 5.68
NME3-203ENST00000563367 ABCC8Q09428 1581 aa50.49■■■■■ 5.67
NME3-203ENST00000563367 DNMBPQ6XZF7 1577 aa50.49■■■■■ 5.67
NME3-203ENST00000563367 IFT140Q96RY7 1462 aa50.28■■■■■ 5.64
NME3-203ENST00000563367 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP50.15■■■■■ 5.62
NME3-203ENST00000563367 CUX1P39880 1505 aa50.14■■■■■ 5.62
NME3-203ENST00000563367 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP50.13■■■■■ 5.62
NME3-203ENST00000563367 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP50.08■■■■■ 5.61
NME3-203ENST00000563367 FGD5Q6ZNL6 1462 aa49.98■■■■■ 5.59
NME3-203ENST00000563367 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.95■■■■■ 5.59
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NME3-203ENST00000563367 SOGA1O94964 1423 aa49.91■■■■■ 5.58
NME3-203ENST00000563367 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP49.82■■■■■ 5.573e-11■■■□□ 16.1
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NME3-203ENST00000563367 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP49.67■■■■■ 5.54
NME3-203ENST00000563367 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa49.63■■■■■ 5.54
NME3-203ENST00000563367 SYNJ1O43426 1573 aa49.63■■■■■ 5.54
NME3-203ENST00000563367 WDR97A6NE52 1622 aa49.63■■■■■ 5.53
NME3-203ENST00000563367 TOP2BQ02880 1626 aa49.62■■■■■ 5.53
NME3-203ENST00000563367 OSCARQ8IYS5 282 aa49.59■■■■■ 5.53
NME3-203ENST00000563367 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa49.46■■■■■ 5.51
NME3-203ENST00000563367 CHD1O14646 1710 aa49.41■■■■■ 5.5
NME3-203ENST00000563367 GRIN2BQ13224 1484 aa49.33■■■■■ 5.49
NME3-203ENST00000563367 GAPVD1Q14C86 1478 aa49.33■■■■■ 5.49
NME3-203ENST00000563367 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.33■■■■■ 5.49
NME3-203ENST00000563367 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa49.32■■■■■ 5.49
NME3-203ENST00000563367 PBRM1Q86U86 1689 aa49.32■■■■■ 5.49
NME3-203ENST00000563367 FBLN2P98095 1184 aa49.24■■■■■ 5.47
NME3-203ENST00000563367 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP49.22■■■■■ 5.47
NME3-203ENST00000563367 SYNJ2O15056 1496 aa49.05■■■■■ 5.44
NME3-203ENST00000563367 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP49.04■■■■■ 5.44
NME3-203ENST00000563367 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.9■■■■■ 5.42
NME3-203ENST00000563367 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.9■■■■■ 5.42
NME3-203ENST00000563367 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.9■■■■■ 5.42
NME3-203ENST00000563367 ADAMTS12P58397 1594 aa48.86■■■■■ 5.41
NME3-203ENST00000563367 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.86■■■■■ 5.41
NME3-203ENST00000563367 ARHGEF11O15085 1522 aa48.82■■■■■ 5.41
NME3-203ENST00000563367 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.8■■■■■ 5.4
NME3-203ENST00000563367 TRIM41Q8WV44 630 aa48.76■■■■■ 5.4
NME3-203ENST00000563367 FHAD1B1AJZ9 1412 aa48.73■■■■■ 5.39
NME3-203ENST00000563367 GRIN2AQ12879 1464 aa48.72■■■■■ 5.39
NME3-203ENST00000563367 KIF27Q86VH2 1401 aa48.63■■■■■ 5.38
NME3-203ENST00000563367 CEP170Q5SW79 1584 aa48.54■■■■■ 5.36
NME3-203ENST00000563367 IGF1RP08069 1367 aa48.51■■■■■ 5.36
NME3-203ENST00000563367 NUP160Q12769 1436 aa48.51■■■■■ 5.36
NME3-203ENST00000563367 ARAP1Q96P48 1450 aa48.43■■■■■ 5.34
NME3-203ENST00000563367 CUL7Q14999 1698 aa48.38■■■■■ 5.34
NME3-203ENST00000563367 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.38■■■■■ 5.34
NME3-203ENST00000563367 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa48.24■■■■■ 5.31
NME3-203ENST00000563367 SHROOM2Q13796 1616 aa48.22■■■■■ 5.31
NME3-203ENST00000563367 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa48.2■■■■■ 5.31
NME3-203ENST00000563367 ERCC6L2Q5T890 1561 aa48.17■■■■■ 5.3
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