Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 FDPS-206ENST00000467076 1178 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.414e-8■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 AC020915.2-201ENST00000591325 4227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.423e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 FDPS-220ENST00000611010 1196 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.534e-8■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 AC017083.4-201ENST00000406334 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.543e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 ZNF8-201ENST00000621650 9128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.673e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 AC020915.6-201ENST00000637233 3042 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.731e-8■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 FDPS-209ENST00000471117 630 ntTSL 38.06□□□□□ -1.124e-8■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 LPP-210ENST00000457242 479 ntTSL 26.47□□□□□ -1.373e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.593e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.943e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.236e-7■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 CSNK2A1-206ENST00000608066 577 ntTSL 414.81□□□□□ -0.046e-7■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 CSNK2A1-209ENST00000609606 589 ntTSL 214.81□□□□□ -0.046e-7■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 CSNK2A1-205ENST00000460062 552 ntTSL 414.81□□□□□ -0.046e-7■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 CSNK2A1-202ENST00000349736 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.966e-7■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 CSNK2A1-201ENST00000217244 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.086e-7■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.436e-7■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 CSNK2A1-208ENST00000609525 581 ntTSL 54.17□□□□□ -1.746e-7■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 HECTD1-204ENST00000553957 4395 ntTSL 24.14□□□□□ -1.751e-7■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 FTX-207ENST00000602576 574 ntTSL 412.18□□□□□ -0.462e-7■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 FTX-208ENST00000602776 561 ntTSL 44.82□□□□□ -1.642e-7■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 CEP85-202ENST00000451429 4061 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.613e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 CEP85-203ENST00000453146 2821 ntTSL 1 (best)9.72□□□□□ -0.853e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 CEP85-206ENST00000476272 3507 ntTSL 28.59□□□□□ -1.033e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 CEP85-209ENST00000640292 2286 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.13e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.283e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.035e-7■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 FBXO31-208ENST00000636077 660 ntTSL 521.79■■□□□ 1.084e-7■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.073e-8■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 PRPSAP1-205ENST00000442767 908 ntTSL 522.83■■□□□ 1.251e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 PRPSAP1-202ENST00000423915 549 ntTSL 416.55■□□□□ 0.241e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 GANAB-206ENST00000526392 257 ntTSL 316.62■□□□□ 0.251e-7■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 GANAB-214ENST00000534613 737 ntTSL 515.59■□□□□ 0.091e-7■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 GANAB-205ENST00000526210 533 ntTSL 415.5■□□□□ 0.071e-7■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 GANAB-204ENST00000525994 390 ntTSL 415.37■□□□□ 0.051e-7■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 GANAB-209ENST00000529737 577 ntTSL 412.12□□□□□ -0.471e-7■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 GANAB-212ENST00000534419 640 ntTSL 411.19□□□□□ -0.621e-7■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 GANAB-215ENST00000534779 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.711e-7■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 UBE3A-208ENST00000625681 654 ntTSL 522.56■■□□□ 1.24e-11■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 UBE3A-214ENST00000627018 474 ntTSL 318.88■□□□□ 0.614e-11■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.043e-6■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.073e-6■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.953e-6■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -23e-6■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.957e-14■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 PCBD2-202ENST00000504352 961 ntTSL 59.23□□□□□ -0.937e-14■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 PCBD2-204ENST00000512783 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.127e-14■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 PCBD2-203ENST00000510013 361 ntTSL 53.1□□□□□ -1.917e-14■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 AC005307.1-201ENST00000567877 1570 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.924e-9■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.634e-7■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 RAB6A-206ENST00000540771 699 ntTSL 522.06■■□□□ 1.128e-8■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.078e-8■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.518e-8■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.458e-8■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.598e-8■■■□□ 18.3
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ILF3Q12906 RAB6A-210ENST00000545625 447 ntTSL 36.77□□□□□ -1.338e-8■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.633e-6■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.473e-6■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 KDM2A-201ENST00000308783 3666 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.833e-6■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 KDM2A-208ENST00000527157 574 ntTSL 24.04□□□□□ -1.763e-6■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.661e-7■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.581e-7■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 AGAP3-209ENST00000469901 582 ntTSL 319.8■□□□□ 0.761e-7■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.481e-7■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 AGAP3-221ENST00000490097 604 ntTSL 414.94□□□□□ -0.021e-7■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 AGAP3-214ENST00000476375 1019 ntTSL 512.99□□□□□ -0.331e-7■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.441e-7■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.511e-7■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 C3-215ENST00000601008 303 ntTSL 55.96□□□□□ -1.462e-10■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 ASPSCR1-221ENST00000585274 984 ntTSL 518.08■□□□□ 0.486e-8■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 PROC-204ENST00000419985 500 ntTSL 421.96■■□□□ 1.113e-8■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 PROC-206ENST00000429925 581 ntTSL 314.09□□□□□ -0.153e-8■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 PROC-210ENST00000474030 501 ntTSL 410.84□□□□□ -0.673e-8■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 AL669831.3-204ENST00000440196 1022 ntTSL 517.41■□□□□ 0.383e-10■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 AL669831.3-205ENST00000641296 1127 nt16.74■□□□□ 0.273e-10■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 AL669831.3-210ENST00000452176 818 ntTSL 1 (best)9.02□□□□□ -0.973e-10■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 FARP1-202ENST00000376581 1021 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.072e-6■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.241e-6■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 CDK19-204ENST00000457688 955 ntTSL 510.62□□□□□ -0.711e-6■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 CDK19-201ENST00000323817 6067 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.991e-6■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.191e-6■■■□□ 18.3
ILF3Q12906 CHKA-204ENST00000528235 570 ntTSL 55.41□□□□□ -1.541e-7■■■□□ 18.2
ILF3Q12906 TCF12-208ENST00000557947 575 ntTSL 421.71■■□□□ 1.077e-7■■■□□ 18.2
ILF3Q12906 TCF12-215ENST00000560190 1183 ntTSL 1 (best)18.88■□□□□ 0.617e-7■■■□□ 18.2
ILF3Q12906 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.217e-7■■■□□ 18.2
ILF3Q12906 TCF12-202ENST00000333725 4719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.497e-7■■■□□ 18.2
ILF3Q12906 TCF12-212ENST00000559609 2252 ntTSL 211.95□□□□□ -0.57e-7■■■□□ 18.2
ILF3Q12906 TCF12-204ENST00000438423 4786 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.537e-7■■■□□ 18.2
ILF3Q12906 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.327e-7■■■□□ 18.2
ILF3Q12906 USP34-204ENST00000453133 1409 ntTSL 54.97□□□□□ -1.612e-7■■■□□ 18.2
ILF3Q12906 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.313e-11■■■□□ 18.2
ILF3Q12906 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.173e-11■■■□□ 18.2
ILF3Q12906 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.073e-11■■■□□ 18.2
ILF3Q12906 CYB5R3-208ENST00000470741 3938 ntTSL 1 (best)12.75□□□□□ -0.373e-11■■■□□ 18.2
ILF3Q12906 CYB5R3-202ENST00000361740 2938 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.713e-11■■■□□ 18.2
ILF3Q12906 GGA2-215ENST00000569189 586 ntTSL 524.19■■□□□ 1.461e-9■■■□□ 18.2
ILF3Q12906 GGA2-203ENST00000562944 388 ntTSL 523.25■■□□□ 1.311e-9■■■□□ 18.2
ILF3Q12906 GGA2-206ENST00000566547 603 ntTSL 222.24■■□□□ 1.151e-9■■■□□ 18.2
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