Protein–RNA interactions for Protein: P26599

PTBP1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP1P26599 REXO5-203ENST00000561474 617 ntTSL 56.79□□□□□ -1.324e-7■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 EHMT1-229ENST00000636081 100 ntTSL 51.43□□□□□ -2.188e-9■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.55e-7■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.585e-7■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 CNOT2-227ENST00000551043 2288 ntTSL 217.47■□□□□ 0.399e-9■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 CNOT2-209ENST00000548159 2549 ntTSL 1 (best)14.82□□□□□ -0.049e-9■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 CNOT2-202ENST00000418359 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.679e-9■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 CNOT2-201ENST00000229195 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.829e-9■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 CNOT2-223ENST00000550160 993 ntTSL 59.8□□□□□ -0.849e-9■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 C14orf159-224ENST00000522816 827 ntTSL 1 (best)8.43□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 DCTN1-220ENST00000477966 766 ntTSL 214.59□□□□□ -0.074e-8■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 DCTN1-217ENST00000463583 569 ntTSL 414.41□□□□□ -0.11e-8■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 DCTN1-216ENST00000462813 342 ntTSL 1 (best)14.41□□□□□ -0.11e-8■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 DCTN1-215ENST00000458655 565 ntTSL 413.96□□□□□ -0.174e-8■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.194e-8■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 DCTN1-210ENST00000434055 4229 ntTSL 211.35□□□□□ -0.594e-8■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 DCTN1-206ENST00000409868 4202 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.694e-8■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 DCTN1-201ENST00000361874 4500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.784e-8■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 DCTN1-227ENST00000633691 4160 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.794e-8■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 DCTN1-202ENST00000394003 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.814e-8■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 DCTN1-204ENST00000409438 4145 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.864e-8■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 DCTN1-226ENST00000628224 4485 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.864e-8■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 DCTN1-205ENST00000409567 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.934e-8■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.76e-7■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.816e-7■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.046e-7■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 UCA1-201ENST00000397381 2299 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.985e-7■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 AL138720.1-202ENST00000437648 1017 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 IGF2BP2-210ENST00000494906 918 ntTSL 57.21□□□□□ -1.261e-8■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 LINC-PINT-203ENST00000429901 565 ntTSL 414.49□□□□□ -0.092e-8■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 SOX6-202ENST00000396356 8865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.152e-7■■■■■ 31.6
PTBP1P26599 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.41e-11■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.11e-11■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 SBNO2-207ENST00000590176 561 ntTSL 414.56□□□□□ -0.081e-11■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 SBNO2-205ENST00000587655 914 ntTSL 311.46□□□□□ -0.571e-11■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 SBNO2-209ENST00000590998 562 ntTSL 410.59□□□□□ -0.711e-11■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 DCAF5-204ENST00000553943 736 ntTSL 315.86■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.033e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.453e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 DCAF5-202ENST00000389997 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.713e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 DCAF5-206ENST00000554681 759 ntTSL 29.86□□□□□ -0.833e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 DCAF5-207ENST00000556111 728 ntTSL 38.66□□□□□ -1.023e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.153e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 DCAF5-208ENST00000556847 2791 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.163e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 PTP4A1-207ENST00000639568 532 ntTSL 57.82□□□□□ -1.163e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 PTP4A1-202ENST00000470661 479 ntTSL 24.96□□□□□ -1.623e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.524e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 SLC25A13-201ENST00000265631 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.044e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 MNAT1-209ENST00000557134 680 ntTSL 33.26□□□□□ -1.892e-9■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 MNAT1-204ENST00000554002 616 ntTSL 31.77□□□□□ -2.132e-9■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 LRMDA-214ENST00000598708 433 ntTSL 37.35□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 LRMDA-204ENST00000488655 307 ntTSL 25.89□□□□□ -1.471e-6■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.292e-12■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.262e-12■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 TMEM39A-203ENST00000461654 588 ntTSL 412.93□□□□□ -0.346e-11■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.514e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.534e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 TMEM39A-205ENST00000468676 935 ntTSL 311.56□□□□□ -0.566e-11■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 FGFR1OP-205ENST00000494781 460 ntTSL 39□□□□□ -0.974e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 TMEM39A-211ENST00000491685 852 ntTSL 58.99□□□□□ -0.976e-11■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 TMEM39A-201ENST00000319172 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.092e-9■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 TMEM39A-208ENST00000486159 826 ntTSL 38.15□□□□□ -1.16e-11■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 TMEM39A-202ENST00000438581 4393 ntTSL 1 (best)7.56□□□□□ -1.22e-9■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 TMEM39A-207ENST00000482162 554 ntTSL 57.43□□□□□ -1.226e-11■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 TMEM39A-210ENST00000490099 868 ntTSL 37.43□□□□□ -1.226e-11■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.274e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 TMEM39A-209ENST00000486235 885 ntTSL 35.37□□□□□ -1.556e-11■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 TMEM39A-212ENST00000497993 590 ntTSL 35.22□□□□□ -1.576e-11■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.594e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 C2orf49-201ENST00000258457 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.039e-25■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 DMXL2-201ENST00000251076 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.82e-9■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 DMXL2-208ENST00000559498 571 ntTSL 55.8□□□□□ -1.482e-9■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 DMXL2-213ENST00000560891 4759 ntTSL 1 (best)5.24□□□□□ -1.572e-9■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.72e-9■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.792e-9■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 DMXL2-204ENST00000558124 578 ntTSL 32.62□□□□□ -1.992e-9■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 SRPK2-211ENST00000482862 329 ntTSL 516.95■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 SRPK2-212ENST00000482897 715 ntTSL 516.2■□□□□ 0.182e-8■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 SRPK2-206ENST00000465112 568 ntTSL 310.96□□□□□ -0.652e-8■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 SRPK2-203ENST00000460391 666 ntTSL 210.46□□□□□ -0.732e-8■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 SRPK2-204ENST00000462282 505 ntTSL 39.41□□□□□ -0.92e-8■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 SRPK2-202ENST00000393651 3650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -12e-8■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 SRPK2-214ENST00000489828 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.142e-8■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 NAT10-202ENST00000527971 1600 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.543e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 NAT10-205ENST00000531159 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.13e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.293e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 NAT10-203ENST00000529523 561 ntTSL 45.97□□□□□ -1.453e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.465e-8■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 TCF4-222ENST00000564228 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.726e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 CCDC18-201ENST00000343253 4867 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.775e-8■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 TCF4-209ENST00000544241 2264 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.86e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 TCF4-262ENST00000628078 1277 ntTSL 510.01□□□□□ -0.816e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 TCF4-211ENST00000561992 2184 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.886e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 TCF4-206ENST00000537856 1996 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.96e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 TCF4-254ENST00000626584 1701 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.916e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 TCF4-208ENST00000543082 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.916e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 TCF4-245ENST00000570177 1872 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -16e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 TCF4-267ENST00000629343 807 ntTSL 57.9□□□□□ -1.146e-7■■■■■ 31.5
PTBP1P26599 TCF4-216ENST00000562680 5733 ntTSL 1 (best)6.82□□□□□ -1.326e-7■■■■■ 31.5
Retrieved 100 of 27,725 protein–RNA pairs in 120.9 ms