Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.278e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.218e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 CDK5RAP3-207ENST00000578134 831 ntTSL 316.21■□□□□ 0.191e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 PRC1-215ENST00000559811 414 ntTSL 315.8■□□□□ 0.121e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.118e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.18e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.068e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 TRIP10-207ENST00000596673 586 ntTSL 314.57□□□□□ -0.088e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.091e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.091e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.091e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.151e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 TRIP10-212ENST00000600677 2022 ntTSL 514.08□□□□□ -0.158e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.161e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.188e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.191e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 CDK5RAP3-236ENST00000584991 1862 ntTSL 513.86□□□□□ -0.191e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.28e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 CDK5RAP3-218ENST00000580391 1957 ntTSL 513.71□□□□□ -0.211e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.268e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 MED15-220ENST00000461076 826 ntTSL 313.35□□□□□ -0.277e-9■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 CDK5RAP3-213ENST00000579605 560 ntTSL 413.29□□□□□ -0.281e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 TRIP10-203ENST00000595305 2068 ntTSL 213.27□□□□□ -0.298e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.318e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 CDK5RAP3-219ENST00000580670 1768 ntTSL 513.09□□□□□ -0.311e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.321e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 NUSAP1-211ENST00000560318 485 ntTSL 512.96□□□□□ -0.338e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.341e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 CDK5RAP3-212ENST00000579175 867 ntTSL 312.6□□□□□ -0.391e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 HRC-203ENST00000595625 2044 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.48e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 AURKB-207ENST00000580998 746 ntTSL 312.52□□□□□ -0.418e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 CDK5RAP3-222ENST00000581708 543 ntTSL 412.46□□□□□ -0.411e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 TRIP10-205ENST00000596078 1010 ntTSL 512.43□□□□□ -0.428e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 CDK5RAP3-237ENST00000585163 2519 ntTSL 1 (best)12.23□□□□□ -0.451e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.478e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 CDK5RAP3-202ENST00000536708 1975 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.491e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.58e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 CDK5RAP3-217ENST00000580287 2609 ntTSL 1 (best)11.7□□□□□ -0.541e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 AL449266.1-201ENST00000357393 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.568e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 SMARCE1-203ENST00000377808 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.591e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 SMARCE1-214ENST00000578112 2384 ntTSL 511.34□□□□□ -0.591e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 CLCC1-207ENST00000369976 2468 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.68e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 CDK5RAP3-232ENST00000584168 2684 ntTSL 511.11□□□□□ -0.631e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 AC018521.1-202ENST00000641877 2655 ntBASIC11.08□□□□□ -0.641e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 AURKB-204ENST00000578549 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.648e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 CLCC1-201ENST00000302500 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.648e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 AURKB-209ENST00000582368 771 ntTSL 310.97□□□□□ -0.658e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 VWDE-201ENST00000275358 5260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.678e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 CDK5RAP3-231ENST00000584063 2759 ntTSL 1 (best)10.82□□□□□ -0.681e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 VWDE-203ENST00000452576 5936 ntTSL 1 (best)10.74□□□□□ -0.698e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 AURKB-212ENST00000584561 1010 ntTSL 310.69□□□□□ -0.78e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 CDK5RAP3-204ENST00000577664 568 ntTSL 410.68□□□□□ -0.71e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 AURKB-213ENST00000584972 739 ntTSL 310.56□□□□□ -0.728e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 AURKB-206ENST00000580390 740 ntTSL 510.36□□□□□ -0.758e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 AURKB-203ENST00000577833 867 ntTSL 310.12□□□□□ -0.798e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 SUPT6H-204ENST00000577939 583 ntTSL 310.09□□□□□ -0.791e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 CDK5RAP3-214ENST00000579632 738 ntTSL 410.09□□□□□ -0.791e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 VWDE-205ENST00000521169 4700 ntTSL 59.84□□□□□ -0.838e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 VWDE-206ENST00000614403 4701 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.838e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 SMARCE1-202ENST00000348513 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.841e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 CDK5RAP3-227ENST00000583352 901 ntTSL 39.66□□□□□ -0.861e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 AC073508.2-201ENST00000476049 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.931e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 CLCC1-206ENST00000369970 2078 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.968e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 AURKB-205ENST00000578753 467 ntTSL 28.95□□□□□ -0.988e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 CDK5RAP3-208ENST00000578525 564 ntTSL 48.33□□□□□ -1.081e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 NRDC-208ENST00000475715 583 ntTSL 38.24□□□□□ -1.098e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 SMARCE1-207ENST00000469334 2128 ntTSL 58□□□□□ -1.131e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.148e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 AURKB-208ENST00000581511 742 ntTSL 57.57□□□□□ -1.28e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.388e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 USP48-206ENST00000464577 2089 ntTSL 26.09□□□□□ -1.438e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.498e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.58e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 DHX36-211ENST00000491011 833 ntTSL 25.55□□□□□ -1.521e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 DHX36-210ENST00000481941 2612 ntTSL 25.14□□□□□ -1.591e-7■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 CLCC1-209ENST00000482889 752 ntTSL 33.44□□□□□ -1.868e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 CLCC1-208ENST00000473062 319 ntTSL 32.89□□□□□ -1.958e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 ACOX1-207ENST00000588176 574 ntTSL 415.8■□□□□ 0.122e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 ACOX1-209ENST00000589301 550 ntTSL 413.8□□□□□ -0.22e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 ACOX1-203ENST00000572047 2441 ntTSL 212.74□□□□□ -0.372e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.412e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 ACOX1-204ENST00000573078 2417 ntTSL 29.94□□□□□ -0.822e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 ACOX1-211ENST00000591857 681 ntTSL 39.9□□□□□ -0.822e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 ACOX1-202ENST00000301608 2215 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.862e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 PDIA3-204ENST00000455250 725 ntTSL 57.59□□□□□ -1.192e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 ACOX1-213ENST00000592329 308 ntTSL 26.14□□□□□ -1.432e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 ACOX1-205ENST00000576743 637 ntTSL 35.36□□□□□ -1.552e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 USP34-204ENST00000453133 1409 ntTSL 54.61□□□□□ -1.672e-6■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 DNAJB1-211ENST00000601533 573 ntTSL 217.57■□□□□ 0.41e-12■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 DNAJB1-206ENST00000596075 573 ntTSL 414.69□□□□□ -0.061e-12■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 DNAJB1-209ENST00000598692 567 ntTSL 212.59□□□□□ -0.391e-12■□□□□ 8.1
TRA2AQ13595 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.163e-8■□□□□ 8
TRA2AQ13595 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.793e-8■□□□□ 8
TRA2AQ13595 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.773e-8■□□□□ 8
TRA2AQ13595 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.583e-8■□□□□ 8
TRA2AQ13595 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.033e-8■□□□□ 8
TRA2AQ13595 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.343e-8■□□□□ 8
TRA2AQ13595 PKM-208ENST00000563275 699 ntTSL 1 (best)12.4□□□□□ -0.423e-8■□□□□ 8
TRA2AQ13595 PKM-224ENST00000569857 1355 ntTSL 511.99□□□□□ -0.493e-8■□□□□ 8
TRA2AQ13595 PKM-222ENST00000568883 1863 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.623e-8■□□□□ 8
Retrieved 100 of 7,337 protein–RNA pairs in 185.5 ms