Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEW3

MARCO, Macrophage receptor MARCO, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCOQ9UEW3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCOQ9UEW3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCOQ9UEW3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCOQ9UEW3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCOQ9UEW3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCOQ9UEW3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCOQ9UEW3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCOQ9UEW3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCOQ9UEW3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCOQ9UEW3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCOQ9UEW3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCOQ9UEW3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MARCOQ9UEW3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCOQ9UEW3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCOQ9UEW3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCOQ9UEW3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCOQ9UEW3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCOQ9UEW3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCOQ9UEW3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCOQ9UEW3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCOQ9UEW3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCOQ9UEW3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCOQ9UEW3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCOQ9UEW3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCOQ9UEW3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCOQ9UEW3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCOQ9UEW3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCOQ9UEW3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCOQ9UEW3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCOQ9UEW3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCOQ9UEW3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCOQ9UEW3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCOQ9UEW3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCOQ9UEW3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCOQ9UEW3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCOQ9UEW3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCOQ9UEW3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MARCOQ9UEW3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MARCOQ9UEW3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MARCOQ9UEW3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCOQ9UEW3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCOQ9UEW3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCOQ9UEW3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCOQ9UEW3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCOQ9UEW3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCOQ9UEW3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCOQ9UEW3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCOQ9UEW3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCOQ9UEW3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCOQ9UEW3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCOQ9UEW3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCOQ9UEW3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCOQ9UEW3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCOQ9UEW3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCOQ9UEW3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARCOQ9UEW3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MARCOQ9UEW3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCOQ9UEW3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCOQ9UEW3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCOQ9UEW3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCOQ9UEW3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCOQ9UEW3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCOQ9UEW3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCOQ9UEW3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCOQ9UEW3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCOQ9UEW3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCOQ9UEW3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCOQ9UEW3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCOQ9UEW3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCOQ9UEW3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCOQ9UEW3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCOQ9UEW3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCOQ9UEW3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCOQ9UEW3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCOQ9UEW3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCOQ9UEW3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCOQ9UEW3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCOQ9UEW3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCOQ9UEW3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCOQ9UEW3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCOQ9UEW3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCOQ9UEW3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCOQ9UEW3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCOQ9UEW3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCOQ9UEW3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCOQ9UEW3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCOQ9UEW3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCOQ9UEW3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCOQ9UEW3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCOQ9UEW3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCOQ9UEW3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCOQ9UEW3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCOQ9UEW3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCOQ9UEW3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCOQ9UEW3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCOQ9UEW3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCOQ9UEW3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCOQ9UEW3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCOQ9UEW3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCOQ9UEW3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms