Protein–RNA interactions for Protein: Q92890

UFD1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1Q92890 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFD1Q92890 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFD1Q92890 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UFD1Q92890 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFD1Q92890 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFD1Q92890 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFD1Q92890 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFD1Q92890 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFD1Q92890 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFD1Q92890 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFD1Q92890 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFD1Q92890 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFD1Q92890 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFD1Q92890 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFD1Q92890 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFD1Q92890 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UFD1Q92890 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UFD1Q92890 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UFD1Q92890 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UFD1Q92890 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UFD1Q92890 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UFD1Q92890 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UFD1Q92890 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UFD1Q92890 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UFD1Q92890 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UFD1Q92890 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFD1Q92890 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFD1Q92890 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFD1Q92890 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFD1Q92890 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFD1Q92890 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFD1Q92890 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFD1Q92890 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFD1Q92890 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFD1Q92890 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFD1Q92890 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFD1Q92890 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UFD1Q92890 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UFD1Q92890 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UFD1Q92890 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UFD1Q92890 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UFD1Q92890 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFD1Q92890 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFD1Q92890 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFD1Q92890 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFD1Q92890 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFD1Q92890 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFD1Q92890 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFD1Q92890 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFD1Q92890 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UFD1Q92890 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UFD1Q92890 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UFD1Q92890 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UFD1Q92890 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFD1Q92890 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UFD1Q92890 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFD1Q92890 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UFD1Q92890 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UFD1Q92890 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UFD1Q92890 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFD1Q92890 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFD1Q92890 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFD1Q92890 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFD1Q92890 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFD1Q92890 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFD1Q92890 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFD1Q92890 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UFD1Q92890 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFD1Q92890 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UFD1Q92890 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UFD1Q92890 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms