Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 GM2A-201ENST00000357164 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.882e-8■■■■■ 35.3
SND1Q7KZF4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.212e-11■■■■■ 35.3
SND1Q7KZF4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.432e-9■■■■■ 35.3
SND1Q7KZF4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.382e-9■■■■■ 35.3
SND1Q7KZF4 HPX-210ENST00000533856 423 ntTSL 312.91□□□□□ -0.342e-9■■■■■ 35.3
SND1Q7KZF4 HPX-205ENST00000528348 919 ntTSL 212.91□□□□□ -0.342e-9■■■■■ 35.3
SND1Q7KZF4 HPX-212ENST00000534800 342 ntTSL 311.49□□□□□ -0.572e-9■■■■■ 35.3
SND1Q7KZF4 COL4A5-208ENST00000505728 537 ntTSL 38.45□□□□□ -1.062e-9■■■■■ 35.3
SND1Q7KZF4 TM9SF1-210ENST00000530563 721 ntTSL 311.07□□□□□ -0.642e-10■■■■■ 35.2
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SND1Q7KZF4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.253e-12■■■■■ 35.2
SND1Q7KZF4 KRT8-208ENST00000547031 883 ntTSL 216.84■□□□□ 0.293e-18■■■■■ 35.1
SND1Q7KZF4 PPIB-203ENST00000561048 1208 ntTSL 1 (best)13.81□□□□□ -0.27e-22■■■■■ 35.1
SND1Q7KZF4 TCN1-205ENST00000534531 684 ntTSL 57.52□□□□□ -1.211e-13■■■■■ 35
SND1Q7KZF4 ABCB1-207ENST00000488737 1864 ntTSL 1 (best)15.56■□□□□ 0.088e-7■■■■■ 35
SND1Q7KZF4 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.067e-8■■■■■ 35
SND1Q7KZF4 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.077e-8■■■■■ 35
SND1Q7KZF4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.362e-10■■■■■ 34.9
SND1Q7KZF4 CTSD-214ENST00000637937 1262 ntTSL 517.53■□□□□ 0.43e-38■■■■■ 34.9
SND1Q7KZF4 ITIH2-206ENST00000480387 573 ntTSL 38.87□□□□□ -0.992e-75■■■■■ 34.9
SND1Q7KZF4 GRN-217ENST00000590984 562 ntTSL 213.71□□□□□ -0.216e-13■■■■■ 34.9
SND1Q7KZF4 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.112e-6■■■■■ 34.9
SND1Q7KZF4 PZP-202ENST00000535230 4417 ntTSL 1 (best)7.75□□□□□ -1.172e-6■■■■■ 34.9
SND1Q7KZF4 ATP1B3-209ENST00000487199 421 ntTSL 35.27□□□□□ -1.573e-11■■■■■ 34.8
SND1Q7KZF4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.883e-8■■■■■ 34.7
SND1Q7KZF4 FKBP2-206ENST00000541388 705 ntTSL 519.56■□□□□ 0.723e-8■■■■■ 34.7
SND1Q7KZF4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.283e-8■■■■■ 34.7
SND1Q7KZF4 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.113e-8■■■■■ 34.7
SND1Q7KZF4 BSG-216ENST00000618112 769 ntTSL 215.86■□□□□ 0.136e-45■■■■■ 34.7
SND1Q7KZF4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.12e-10■■■■■ 34.7
SND1Q7KZF4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.722e-10■■■■■ 34.7
SND1Q7KZF4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.642e-10■■■■■ 34.7
SND1Q7KZF4 CD276-204ENST00000557951 695 ntTSL 216.25■□□□□ 0.191e-17■■■■■ 34.7
SND1Q7KZF4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.112e-10■■■■■ 34.7
SND1Q7KZF4 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.12e-10■■■■■ 34.7
SND1Q7KZF4 CYB561D2-206ENST00000490926 707 ntTSL 210.39□□□□□ -0.752e-10■■■■■ 34.7
SND1Q7KZF4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.281e-323■■■■■ 34.7
SND1Q7KZF4 RAE1-204ENST00000411894 588 ntTSL 510.47□□□□□ -0.732e-9■■■■■ 34.6
SND1Q7KZF4 RAE1-205ENST00000429339 480 ntTSL 510.47□□□□□ -0.732e-9■■■■■ 34.6
SND1Q7KZF4 GBA-214ENST00000497670 696 ntTSL 59.87□□□□□ -0.832e-9■■■■■ 34.6
SND1Q7KZF4 RAE1-206ENST00000452119 691 ntTSL 38.17□□□□□ -1.12e-9■■■■■ 34.6
SND1Q7KZF4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.84e-12■■■■■ 34.5
SND1Q7KZF4 APMAP-202ENST00000451442 2117 ntTSL 514.53□□□□□ -0.084e-12■■■■■ 34.5
SND1Q7KZF4 SLC3A2-223ENST00000546312 564 ntTSL 29.88□□□□□ -0.831e-14■■■■■ 34.4
SND1Q7KZF4 POR-217ENST00000460892 603 ntTSL 213.94□□□□□ -0.181e-21■■■■■ 34.4
SND1Q7KZF4 FAF2-201ENST00000261942 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.099e-7■■■■■ 34.3
SND1Q7KZF4 TM9SF1-207ENST00000528895 961 ntTSL 212.32□□□□□ -0.442e-10■■■■■ 34.3
SND1Q7KZF4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.468e-8■■■■■ 34.2
SND1Q7KZF4 ITM2B-202ENST00000378565 10137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.388e-8■■■■■ 34.2
SND1Q7KZF4 SERPINA3-209ENST00000621603 639 nt8.29□□□□□ -1.085e-81■■■■■ 34.2
SND1Q7KZF4 CTSD-203ENST00000429746 690 ntTSL 317.94■□□□□ 0.463e-38■■■■■ 34.2
SND1Q7KZF4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.414e-7■■■■■ 34.2
SND1Q7KZF4 PIGU-203ENST00000438215 509 ntTSL 39.54□□□□□ -0.884e-7■■■■■ 34.2
SND1Q7KZF4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.062e-10■■■■■ 34.1
SND1Q7KZF4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 12e-10■■■■■ 34.1
SND1Q7KZF4 SEC11A-205ENST00000558217 882 ntTSL 213.54□□□□□ -0.242e-10■■■■■ 34.1
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SND1Q7KZF4 SEC11A-202ENST00000455959 1223 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.082e-10■■■■■ 34.1
SND1Q7KZF4 SEC11A-209ENST00000560266 1089 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.092e-10■■■■■ 34.1
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SND1Q7KZF4 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.14e-8■■■■■ 34.1
SND1Q7KZF4 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.14e-8■■■■■ 34.1
SND1Q7KZF4 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.043e-9■■■■■ 34.1
SND1Q7KZF4 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.063e-9■■■■■ 34.1
SND1Q7KZF4 MPZL2-206ENST00000529376 1531 ntTSL 214.61□□□□□ -0.073e-9■■■■■ 34.1
SND1Q7KZF4 HIST1H4H-204ENST00000635491 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.743e-15■■■■■ 34.1
SND1Q7KZF4 HIST1H4H-202ENST00000634560 1034 ntTSL 1 (best)10.41□□□□□ -0.743e-15■■■■■ 34.1
SND1Q7KZF4 HIST1H4H-201ENST00000377727 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.793e-15■■■■■ 34.1
SND1Q7KZF4 MPZL2-207ENST00000534175 1317 ntTSL 59.95□□□□□ -0.823e-9■■■■■ 34.1
SND1Q7KZF4 HIST1H4H-203ENST00000634956 2163 ntTSL 58.17□□□□□ -1.13e-15■■■■■ 34.1
SND1Q7KZF4 HPX-207ENST00000529775 803 ntTSL 212.23□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 34
SND1Q7KZF4 LAMB1-211ENST00000476039 653 ntTSL 212.92□□□□□ -0.345e-11■■■■■ 34
SND1Q7KZF4 SERPINA1-215ENST00000556955 571 ntTSL 414.4□□□□□ -0.11e-323■■■■■ 34
SND1Q7KZF4 SERPINH1-206ENST00000526242 474 ntTSL 418.8■□□□□ 0.62e-19■■■■■ 34
SND1Q7KZF4 TGFBI-211ENST00000513497 588 ntTSL 211.77□□□□□ -0.535e-14■■■■■ 34
SND1Q7KZF4 SERPINE2-208ENST00000473202 5989 ntTSL 29.36□□□□□ -0.917e-7■■■■■ 33.9
SND1Q7KZF4 CD81-214ENST00000530239 425 ntTSL 225.39■■□□□ 1.668e-14■■■■■ 33.9
SND1Q7KZF4 CD81-217ENST00000533417 444 ntTSL 317.88■□□□□ 0.458e-14■■■■■ 33.9
SND1Q7KZF4 AP000781.2-203ENST00000528835 533 ntTSL 317.68■□□□□ 0.422e-27■■■■■ 33.9
SND1Q7KZF4 PRCP-210ENST00000531283 565 ntTSL 35.14□□□□□ -1.592e-9■■■■■ 33.9
SND1Q7KZF4 HAT1-204ENST00000457761 1642 ntTSL 1 (best)11.26□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 33.8
SND1Q7KZF4 HAT1-206ENST00000494601 3845 ntTSL 1 (best)11.2□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 33.8
SND1Q7KZF4 HAT1-203ENST00000412731 1567 ntTSL 1 (best)8.16□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 33.8
SND1Q7KZF4 HAT1-202ENST00000392584 3609 ntTSL 27.71□□□□□ -1.182e-7■■■■■ 33.8
SND1Q7KZF4 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.52e-7■■■■■ 33.8
SND1Q7KZF4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.761e-11■■■■■ 33.8
SND1Q7KZF4 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.191e-11■■■■■ 33.8
SND1Q7KZF4 GM2A-203ENST00000523466 553 ntTSL 38.14□□□□□ -1.113e-8■■■■■ 33.8
SND1Q7KZF4 GM2A-202ENST00000523004 643 ntTSL 1 (best)8.14□□□□□ -1.112e-8■■■■■ 33.8
SND1Q7KZF4 PSMC4-204ENST00000596386 929 ntTSL 216.18■□□□□ 0.186e-7■■■■■ 33.8
SND1Q7KZF4 PSMC4-205ENST00000601194 650 ntTSL 314.77□□□□□ -0.056e-7■■■■■ 33.8
SND1Q7KZF4 GANAB-203ENST00000524437 671 ntTSL 219.8■□□□□ 0.766e-28■■■■■ 33.8
SND1Q7KZF4 GANAB-206ENST00000526392 257 ntTSL 317.26■□□□□ 0.356e-28■■■■■ 33.8
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