RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530239.1

CD81-214, Transcript of CD81 molecule, humanhuman

TSL 2

Gene CD81, Length 425 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD81-214ENST00000530239 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.45■■■■■ 7.11
CD81-214ENST00000530239 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.95■■■■■ 6.07
CD81-214ENST00000530239 ABCC9O60706 1549 aa51.66■■■■■ 5.86
CD81-214ENST00000530239 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.81■■■■■ 5.56
CD81-214ENST00000530239 NACADO15069 1562 aa49.75■■■■■ 5.56
CD81-214ENST00000530239 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.55■■■■■ 5.52
CD81-214ENST00000530239 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.55■■■■■ 5.52
CD81-214ENST00000530239 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.49■■■■■ 5.51
CD81-214ENST00000530239 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.27■■■■■ 5.48
CD81-214ENST00000530239 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.65■■■■■ 5.38
CD81-214ENST00000530239 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.22■■■■■ 5.31
CD81-214ENST00000530239 SCRIBQ14160 1630 aa48.21■■■■■ 5.31
CD81-214ENST00000530239 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.21■■■■■ 5.31
CD81-214ENST00000530239 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.86■■■■■ 5.25
CD81-214ENST00000530239 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.3■■■■■ 5.16
CD81-214ENST00000530239 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.98■■■■■ 5.11
CD81-214ENST00000530239 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.78■■■■■ 5.08
CD81-214ENST00000530239 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.45■■■■■ 5.03
CD81-214ENST00000530239 SMARCA4P51532 1647 aa46.15■■■■■ 4.98
CD81-214ENST00000530239 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.13■■■■■ 4.97
CD81-214ENST00000530239 SMARCA2P51531 1590 aa45.88■■■■■ 4.94
CD81-214ENST00000530239 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.87■■■■■ 4.93
CD81-214ENST00000530239 NCAPD3P42695 1498 aa45.87■■■■■ 4.93
CD81-214ENST00000530239 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.78■■■■■ 4.92
CD81-214ENST00000530239 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.74■■■■■ 4.91
CD81-214ENST00000530239 HMGXB3Q12766 1538 aa45.69■■■■■ 4.9
CD81-214ENST00000530239 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.52■■■■■ 4.88
CD81-214ENST00000530239 WIZO95785 1651 aa45.3■■■■■ 4.84
CD81-214ENST00000530239 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.26■■■■■ 4.84
CD81-214ENST00000530239 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.88■■■■■ 4.78
CD81-214ENST00000530239 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.7■■■■■ 4.75
CD81-214ENST00000530239 NESP48681 1621 aa44.68■■■■■ 4.74
CD81-214ENST00000530239 ERCC6Q03468 1493 aa44.59■■■■■ 4.73
CD81-214ENST00000530239 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.51■■■■■ 4.72
CD81-214ENST00000530239 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.38■■■■■ 4.69
CD81-214ENST00000530239 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.28■■■■■ 4.68
CD81-214ENST00000530239 CFTRP13569 1480 aa44.27■■■■■ 4.68
CD81-214ENST00000530239 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.24■■■■■ 4.67
CD81-214ENST00000530239 CUX2O14529 1486 aa44.15■■■■■ 4.66
CD81-214ENST00000530239 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.1■■■■■ 4.65
CD81-214ENST00000530239 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
CD81-214ENST00000530239 PRDM2Q13029 1718 aa44.03■■■■■ 4.64
CD81-214ENST00000530239 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.01■■■■■ 4.64
CD81-214ENST00000530239 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.98■■■■■ 4.63
CD81-214ENST00000530239 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.91■■■■■ 4.62
CD81-214ENST00000530239 WDR62O43379 1518 aa43.78■■■■■ 4.6
CD81-214ENST00000530239 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.54■■■■■ 4.56
CD81-214ENST00000530239 ABCC8Q09428 1581 aa43.37■■■■■ 4.53
CD81-214ENST00000530239 TOPBP1Q92547 1522 aa43.31■■■■■ 4.52
CD81-214ENST00000530239 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.29■■■■■ 4.52
CD81-214ENST00000530239 IFT140Q96RY7 1462 aa43.06■■■■■ 4.48
CD81-214ENST00000530239 CUX1P39880 1505 aa42.96■■■■■ 4.47
CD81-214ENST00000530239 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.94■■■■■ 4.46
CD81-214ENST00000530239 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.84■■■■■ 4.45
CD81-214ENST00000530239 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.83■■■■■ 4.45
CD81-214ENST00000530239 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.78■■■■■ 4.44
CD81-214ENST00000530239 SOGA1O94964 1423 aa42.75■■■■■ 4.43
CD81-214ENST00000530239 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.71■■■■■ 4.439e-6■■■■■ 50.1
CD81-214ENST00000530239 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.69■■■■■ 4.43
CD81-214ENST00000530239 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.69■■■■■ 4.42
CD81-214ENST00000530239 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.69■■■■■ 4.42
CD81-214ENST00000530239 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.66■■■■■ 4.42
CD81-214ENST00000530239 TOP2BQ02880 1626 aa42.64■■■■■ 4.42
CD81-214ENST00000530239 WDR97A6NE52 1622 aa42.62■■■■■ 4.41
CD81-214ENST00000530239 SYNJ1O43426 1573 aa42.59■■■■■ 4.41
CD81-214ENST00000530239 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.55■■■■■ 4.44e-7■■□□□ 14.5
CD81-214ENST00000530239 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
CD81-214ENST00000530239 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.45■■■■■ 4.39
CD81-214ENST00000530239 GRIN2BQ13224 1484 aa42.29■■■■■ 4.36
CD81-214ENST00000530239 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.28■■■■■ 4.36
CD81-214ENST00000530239 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.27■■■■■ 4.36
CD81-214ENST00000530239 OSCARQ8IYS5 282 aa42.25■■■■■ 4.35
CD81-214ENST00000530239 PBRM1Q86U86 1689 aa42.23■■■■■ 4.35
CD81-214ENST00000530239 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.2■■■■■ 4.35
CD81-214ENST00000530239 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
CD81-214ENST00000530239 CHD1O14646 1710 aa42.15■■■■■ 4.34
CD81-214ENST00000530239 FBLN2P98095 1184 aa42.02■■■■■ 4.32
CD81-214ENST00000530239 SYNJ2O15056 1496 aa42.01■■■■■ 4.32
CD81-214ENST00000530239 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.97■■■■■ 4.31
CD81-214ENST00000530239 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
CD81-214ENST00000530239 ADAMTS12P58397 1594 aa41.88■■■■■ 4.3
CD81-214ENST00000530239 KIF27Q86VH2 1401 aa41.84■■■■■ 4.29
CD81-214ENST00000530239 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.8■■■■■ 4.28
CD81-214ENST00000530239 GRIN2AQ12879 1464 aa41.73■■■■■ 4.27
CD81-214ENST00000530239 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.69■■■■■ 4.27
CD81-214ENST00000530239 TRIM41Q8WV44 630 aa41.66■■■■■ 4.26
CD81-214ENST00000530239 CUL7Q14999 1698 aa41.61■■■■■ 4.25
CD81-214ENST00000530239 IGF1RP08069 1367 aa41.61■■■■■ 4.25
CD81-214ENST00000530239 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.6■■■■■ 4.25
CD81-214ENST00000530239 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.6■■■■■ 4.25
CD81-214ENST00000530239 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.6■■■■■ 4.25
CD81-214ENST00000530239 ARHGEF11O15085 1522 aa41.59■■■■■ 4.25
CD81-214ENST00000530239 NUP160Q12769 1436 aa41.55■■■■■ 4.24
CD81-214ENST00000530239 CEP170Q5SW79 1584 aa41.5■■■■■ 4.23
CD81-214ENST00000530239 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.38■■■■■ 4.22
CD81-214ENST00000530239 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.34■■■■■ 4.21
CD81-214ENST00000530239 SHROOM2Q13796 1616 aa41.26■■■■■ 4.19
CD81-214ENST00000530239 ARAP1Q96P48 1450 aa41.25■■■■■ 4.19
CD81-214ENST00000530239 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.17■■■■■ 4.18
CD81-214ENST00000530239 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.16■■■■■ 4.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108 ms