Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SND1Q7KZF4 AL627171.2-201ENST00000635177 1090 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.881e-96■■■■■ 347.1
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SND1Q7KZF4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.088e-12■■■■■ 71.4
SND1Q7KZF4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.361e-15■■■■■ 71.4
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SND1Q7KZF4 ERP29-204ENST00000552052 284 ntTSL 310.98□□□□□ -0.652e-13■■■■■ 63.1
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SND1Q7KZF4 HSPA5-201ENST00000324460 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.532e-31■■■■■ 62
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SND1Q7KZF4 SPARC-204ENST00000521569 602 ntTSL 28.82□□□□□ -19e-10■■■■■ 59.7
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SND1Q7KZF4 SERPINC1-202ENST00000487183 626 ntTSL 28.83□□□□□ -14e-9■■■■■ 58.4
SND1Q7KZF4 GSN-201ENST00000373806 879 ntTSL 219.62■□□□□ 0.734e-20■■■■■ 58.3
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SND1Q7KZF4 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 57.5
SND1Q7KZF4 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.222e-7■■■■■ 57.5
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SND1Q7KZF4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.414e-28■■■■■ 53.3
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SND1Q7KZF4 EMP3-205ENST00000597057 406 ntTSL 212.31□□□□□ -0.442e-12■■■■■ 53.2
SND1Q7KZF4 EMP3-202ENST00000593437 502 ntTSL 511.07□□□□□ -0.641e-9■■■■■ 53.2
SND1Q7KZF4 EMP3-206ENST00000597279 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.71e-9■■■■■ 53.2
SND1Q7KZF4 EMP3-201ENST00000270221 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.71e-9■■■■■ 53.2
SND1Q7KZF4 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.121e-14■■■■■ 53
SND1Q7KZF4 BSG-213ENST00000613627 689 ntTSL 316.45■□□□□ 0.225e-28■■■■■ 52.9
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SND1Q7KZF4 VTN-203ENST00000542029 501 ntTSL 311.75□□□□□ -0.536e-18■■■■■ 52.6
SND1Q7KZF4 P4HA2-219ENST00000478055 929 ntTSL 210.03□□□□□ -0.81e-9■■■■■ 52.5
SND1Q7KZF4 P4HA2-208ENST00000416053 582 ntTSL 38.17□□□□□ -1.11e-9■■■■■ 52.5
SND1Q7KZF4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.194e-8■■■■■ 52.4
SND1Q7KZF4 A1BG-202ENST00000595014 2301 ntTSL 220.54■□□□□ 0.884e-8■■■■■ 52.4
SND1Q7KZF4 AC012313.3-201ENST00000600123 1765 ntTSL 1 (best)19.72■□□□□ 0.754e-8■■■■■ 52.4
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SND1Q7KZF4 AC005833.3-201ENST00000543979 864 ntTSL 29.92□□□□□ -0.823e-14■■■■■ 52.3
SND1Q7KZF4 NDUFA9-201ENST00000266544 8363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.913e-14■■■■■ 52.3
SND1Q7KZF4 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.183e-14■■■■■ 52.3
SND1Q7KZF4 FGB-204ENST00000497097 574 ntTSL 1 (best)11.97□□□□□ -0.493e-26■■■■■ 52.2
SND1Q7KZF4 FGB-202ENST00000425838 565 ntTSL 410.86□□□□□ -0.673e-26■■■■■ 52.2
SND1Q7KZF4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.065e-83■■■■■ 52.2
SND1Q7KZF4 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.15e-83■■■■■ 52.2
SND1Q7KZF4 PRG2-203ENST00000530105 1048 ntTSL 513.16□□□□□ -0.35e-83■■■■■ 52.2
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