RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513497.1

TGFBI-211, Transcript of transforming growth factor beta induced, humanhuman

TSL 2

Gene TGFBI, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBI-211ENST00000513497 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.54■■■□□ 2.32
TGFBI-211ENST00000513497 ABCC9O60706 1549 aa27.02■■□□□ 1.92
TGFBI-211ENST00000513497 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.64■■□□□ 1.85
TGFBI-211ENST00000513497 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.87■■□□□ 1.73
TGFBI-211ENST00000513497 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.52■■□□□ 1.68
TGFBI-211ENST00000513497 NACADO15069 1562 aa25.3■■□□□ 1.64
TGFBI-211ENST00000513497 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.616e-8■□□□□ 10.5
TGFBI-211ENST00000513497 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.95■■□□□ 1.58
TGFBI-211ENST00000513497 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.95■■□□□ 1.58
TGFBI-211ENST00000513497 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.92■■□□□ 1.58
TGFBI-211ENST00000513497 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.83■■□□□ 1.57
TGFBI-211ENST00000513497 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.54■■□□□ 1.52
TGFBI-211ENST00000513497 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.43■■□□□ 1.5
TGFBI-211ENST00000513497 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
TGFBI-211ENST00000513497 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.41■■□□□ 1.5
TGFBI-211ENST00000513497 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.41■■□□□ 1.5
TGFBI-211ENST00000513497 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TGFBI-211ENST00000513497 SCRIBQ14160 1630 aa24.19■■□□□ 1.46
TGFBI-211ENST00000513497 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24■■□□□ 1.43
TGFBI-211ENST00000513497 CUX2O14529 1486 aa23.5■■□□□ 1.35
TGFBI-211ENST00000513497 NCAPD3P42695 1498 aa23.43■■□□□ 1.34
TGFBI-211ENST00000513497 ERCC6Q03468 1493 aa23.27■■□□□ 1.32
TGFBI-211ENST00000513497 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.27■■□□□ 1.32
TGFBI-211ENST00000513497 HMGXB3Q12766 1538 aa23.18■■□□□ 1.3
TGFBI-211ENST00000513497 NESP48681 1621 aa23.15■■□□□ 1.3
TGFBI-211ENST00000513497 SMARCA2P51531 1590 aa23.11■■□□□ 1.29
TGFBI-211ENST00000513497 SMARCA4P51532 1647 aa23.1■■□□□ 1.29
TGFBI-211ENST00000513497 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
TGFBI-211ENST00000513497 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.97■■□□□ 1.27
TGFBI-211ENST00000513497 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TGFBI-211ENST00000513497 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TGFBI-211ENST00000513497 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.88■■□□□ 1.25
TGFBI-211ENST00000513497 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.76■■□□□ 1.23
TGFBI-211ENST00000513497 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.75■■□□□ 1.23
TGFBI-211ENST00000513497 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.74■■□□□ 1.23
TGFBI-211ENST00000513497 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.64■■□□□ 1.22
TGFBI-211ENST00000513497 WDR62O43379 1518 aa22.61■■□□□ 1.21
TGFBI-211ENST00000513497 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.6■■□□□ 1.21
TGFBI-211ENST00000513497 TRIM41Q8WV44 630 aa22.57■■□□□ 1.2
TGFBI-211ENST00000513497 WIZO95785 1651 aa22.39■■□□□ 1.18
TGFBI-211ENST00000513497 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.39■■□□□ 1.17
TGFBI-211ENST00000513497 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.36■■□□□ 1.17
TGFBI-211ENST00000513497 CFTRP13569 1480 aa22.34■■□□□ 1.17
TGFBI-211ENST00000513497 OSCARQ8IYS5 282 aa22.28■■□□□ 1.16
TGFBI-211ENST00000513497 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TGFBI-211ENST00000513497 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
TGFBI-211ENST00000513497 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TGFBI-211ENST00000513497 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.09■■□□□ 1.13
TGFBI-211ENST00000513497 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.09■■□□□ 1.13
TGFBI-211ENST00000513497 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.09■■□□□ 1.13
TGFBI-211ENST00000513497 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
TGFBI-211ENST00000513497 ARHGEF11O15085 1522 aa22.01■■□□□ 1.11
TGFBI-211ENST00000513497 IFT140Q96RY7 1462 aa21.99■■□□□ 1.11
TGFBI-211ENST00000513497 PRDM2Q13029 1718 aa21.92■■□□□ 1.1
TGFBI-211ENST00000513497 TOPBP1Q92547 1522 aa21.91■■□□□ 1.1
TGFBI-211ENST00000513497 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.89■■□□□ 1.09
TGFBI-211ENST00000513497 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TGFBI-211ENST00000513497 ARAP1Q96P48 1450 aa21.8■■□□□ 1.08
TGFBI-211ENST00000513497 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
TGFBI-211ENST00000513497 ABCC8Q09428 1581 aa21.77■■□□□ 1.08
TGFBI-211ENST00000513497 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.77■■□□□ 1.08
TGFBI-211ENST00000513497 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.76■■□□□ 1.07
TGFBI-211ENST00000513497 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.75■■□□□ 1.07
TGFBI-211ENST00000513497 CHD1O14646 1710 aa21.7■■□□□ 1.06
TGFBI-211ENST00000513497 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
TGFBI-211ENST00000513497 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.59■■□□□ 1.05
TGFBI-211ENST00000513497 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.58■■□□□ 1.04
TGFBI-211ENST00000513497 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
TGFBI-211ENST00000513497 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TGFBI-211ENST00000513497 FBLN2P98095 1184 aa21.51■■□□□ 1.03
TGFBI-211ENST00000513497 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.51■■□□□ 1.03
TGFBI-211ENST00000513497 SOGA1O94964 1423 aa21.5■■□□□ 1.03
TGFBI-211ENST00000513497 WDR97A6NE52 1622 aa21.48■■□□□ 1.03
TGFBI-211ENST00000513497 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.45■■□□□ 1.02
TGFBI-211ENST00000513497 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
TGFBI-211ENST00000513497 CUX1P39880 1505 aa21.4■■□□□ 1.02
TGFBI-211ENST00000513497 SYNJ1O43426 1573 aa21.4■■□□□ 1.02
TGFBI-211ENST00000513497 GRIN2BQ13224 1484 aa21.39■■□□□ 1.01
TGFBI-211ENST00000513497 SYNJ2O15056 1496 aa21.38■■□□□ 1.01
TGFBI-211ENST00000513497 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
TGFBI-211ENST00000513497 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.3■■□□□ 1
TGFBI-211ENST00000513497 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.22■□□□□ 0.99
TGFBI-211ENST00000513497 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.22■□□□□ 0.99
TGFBI-211ENST00000513497 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.21■□□□□ 0.99
TGFBI-211ENST00000513497 PBRM1Q86U86 1689 aa21.2■□□□□ 0.98
TGFBI-211ENST00000513497 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
TGFBI-211ENST00000513497 NUP160Q12769 1436 aa21.14■□□□□ 0.98
TGFBI-211ENST00000513497 GRIN2AQ12879 1464 aa21.13■□□□□ 0.97
TGFBI-211ENST00000513497 CEP170Q5SW79 1584 aa21.1■□□□□ 0.97
TGFBI-211ENST00000513497 SHROOM2Q13796 1616 aa21.08■□□□□ 0.97
TGFBI-211ENST00000513497 ADAMTS12P58397 1594 aa21.07■□□□□ 0.96
TGFBI-211ENST00000513497 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.98■□□□□ 0.95
TGFBI-211ENST00000513497 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.97■□□□□ 0.95
TGFBI-211ENST00000513497 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.94■□□□□ 0.94
TGFBI-211ENST00000513497 TOP2BQ02880 1626 aa20.92■□□□□ 0.94
TGFBI-211ENST00000513497 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.91■□□□□ 0.94
TGFBI-211ENST00000513497 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.91■□□□□ 0.94
TGFBI-211ENST00000513497 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
TGFBI-211ENST00000513497 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.84■□□□□ 0.93
TGFBI-211ENST00000513497 JPH4Q96JJ6 628 aa20.81■□□□□ 0.92
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