Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.324e-20■■■■■ 74.6
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PRPF8Q6P2Q9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.274e-20■■■■■ 74.6
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PRPF8Q6P2Q9 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.482e-15■■■■■ 72.5
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PRPF8Q6P2Q9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.067e-8■■■■■ 72.4
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PRPF8Q6P2Q9 ABCA2-220ENST00000490486 666 ntTSL 213.48□□□□□ -0.253e-16■■■■■ 72.2
PRPF8Q6P2Q9 FANCI-212ENST00000566895 4663 ntTSL 25□□□□□ -1.612e-10■■■■■ 72.2
PRPF8Q6P2Q9 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.522e-8■■■■■ 72.1
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PRPF8Q6P2Q9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.32e-19■■■■■ 72.1
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PRPF8Q6P2Q9 CCND3-208ENST00000505672 932 ntTSL 215.61■□□□□ 0.092e-19■■■■■ 72.1
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PRPF8Q6P2Q9 CCND3-219ENST00000513956 562 ntTSL 215.6■□□□□ 0.092e-19■■■■■ 72.1
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PRPF8Q6P2Q9 CCND3-214ENST00000511161 579 ntTSL 415.6■□□□□ 0.092e-19■■■■■ 72.1
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