RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556685.1

TTLL5-216, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 5, humanhuman

TSL 4

Gene TTLL5, Length 689 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL5-216ENST00000556685 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.21■■■■■ 5.31
TTLL5-216ENST00000556685 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.74■■■■■ 4.43
TTLL5-216ENST00000556685 ABCC9O60706 1549 aa41.63■■■■■ 4.25
TTLL5-216ENST00000556685 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.25■■■■■ 4.03
TTLL5-216ENST00000556685 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
TTLL5-216ENST00000556685 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.13■■■■■ 4.01
TTLL5-216ENST00000556685 NACADO15069 1562 aa40.12■■■■■ 4.01
TTLL5-216ENST00000556685 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.93■■■■□ 3.98
TTLL5-216ENST00000556685 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.87■■■■□ 3.97
TTLL5-216ENST00000556685 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.19■■■■□ 3.86
TTLL5-216ENST00000556685 SCRIBQ14160 1630 aa39.08■■■■□ 3.85
TTLL5-216ENST00000556685 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.94■■■■□ 3.82
TTLL5-216ENST00000556685 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.87■■■■□ 3.81
TTLL5-216ENST00000556685 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.48■■■■□ 3.75
TTLL5-216ENST00000556685 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.91■■■■□ 3.66
TTLL5-216ENST00000556685 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.86■■■■□ 3.65
TTLL5-216ENST00000556685 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.64■■■■□ 3.62
TTLL5-216ENST00000556685 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.54■■■■□ 3.6
TTLL5-216ENST00000556685 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.37■■■■□ 3.57
TTLL5-216ENST00000556685 SMARCA4P51532 1647 aa37.36■■■■□ 3.57
TTLL5-216ENST00000556685 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.17■■■■□ 3.54
TTLL5-216ENST00000556685 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.09■■■■□ 3.53
TTLL5-216ENST00000556685 SMARCA2P51531 1590 aa37.06■■■■□ 3.52
TTLL5-216ENST00000556685 NCAPD3P42695 1498 aa37.01■■■■□ 3.51
TTLL5-216ENST00000556685 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.96■■■■□ 3.51
TTLL5-216ENST00000556685 HMGXB3Q12766 1538 aa36.87■■■■□ 3.49
TTLL5-216ENST00000556685 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.84■■■■□ 3.49
TTLL5-216ENST00000556685 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
TTLL5-216ENST00000556685 WIZO95785 1651 aa36.8■■■■□ 3.48
TTLL5-216ENST00000556685 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
TTLL5-216ENST00000556685 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
TTLL5-216ENST00000556685 NESP48681 1621 aa36.08■■■■□ 3.37
TTLL5-216ENST00000556685 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.01■■■■□ 3.35
TTLL5-216ENST00000556685 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.99■■■■□ 3.35
TTLL5-216ENST00000556685 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.97■■■■□ 3.35
TTLL5-216ENST00000556685 ERCC6Q03468 1493 aa35.88■■■■□ 3.33
TTLL5-216ENST00000556685 CFTRP13569 1480 aa35.8■■■■□ 3.32
TTLL5-216ENST00000556685 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.78■■■■□ 3.32
TTLL5-216ENST00000556685 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.66■■■■□ 3.3
TTLL5-216ENST00000556685 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.58■■■■□ 3.29
TTLL5-216ENST00000556685 PRDM2Q13029 1718 aa35.54■■■■□ 3.28
TTLL5-216ENST00000556685 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.52■■■■□ 3.28
TTLL5-216ENST00000556685 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
TTLL5-216ENST00000556685 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.41■■■■□ 3.26
TTLL5-216ENST00000556685 CUX2O14529 1486 aa35.35■■■■□ 3.25
TTLL5-216ENST00000556685 WDR62O43379 1518 aa35.27■■■■□ 3.24
TTLL5-216ENST00000556685 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
TTLL5-216ENST00000556685 TOPBP1Q92547 1522 aa35.03■■■■□ 3.2
TTLL5-216ENST00000556685 ABCC8Q09428 1581 aa35.02■■■■□ 3.2
TTLL5-216ENST00000556685 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.01■■■■□ 3.2
TTLL5-216ENST00000556685 CUX1P39880 1505 aa34.86■■■■□ 3.17
TTLL5-216ENST00000556685 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.15
TTLL5-216ENST00000556685 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.75■■■■□ 3.15
TTLL5-216ENST00000556685 IFT140Q96RY7 1462 aa34.74■■■■□ 3.15
TTLL5-216ENST00000556685 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.71■■■■□ 3.15
TTLL5-216ENST00000556685 SYNJ1O43426 1573 aa34.65■■■■□ 3.14
TTLL5-216ENST00000556685 TOP2BQ02880 1626 aa34.63■■■■□ 3.13
TTLL5-216ENST00000556685 SOGA1O94964 1423 aa34.62■■■■□ 3.13
TTLL5-216ENST00000556685 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.62■■■■□ 3.13
TTLL5-216ENST00000556685 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.61■■■■□ 3.13
TTLL5-216ENST00000556685 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
TTLL5-216ENST00000556685 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.12
TTLL5-216ENST00000556685 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
TTLL5-216ENST00000556685 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.41■■■■□ 3.1
TTLL5-216ENST00000556685 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
TTLL5-216ENST00000556685 WDR97A6NE52 1622 aa34.39■■■■□ 3.1
TTLL5-216ENST00000556685 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.37■■■■□ 3.09
TTLL5-216ENST00000556685 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.22■■■■□ 3.07
TTLL5-216ENST00000556685 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.22■■■■□ 3.07
TTLL5-216ENST00000556685 GRIN2BQ13224 1484 aa34.18■■■■□ 3.06
TTLL5-216ENST00000556685 PBRM1Q86U86 1689 aa34.13■■■■□ 3.05
TTLL5-216ENST00000556685 TRIM41Q8WV44 630 aa34.13■■■■□ 3.05
TTLL5-216ENST00000556685 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.12■■■■□ 3.05
TTLL5-216ENST00000556685 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
TTLL5-216ENST00000556685 KIF27Q86VH2 1401 aa34■■■■□ 3.03
TTLL5-216ENST00000556685 FBLN2P98095 1184 aa33.99■■■■□ 3.03
TTLL5-216ENST00000556685 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.97■■■■□ 3.03
TTLL5-216ENST00000556685 CHD1O14646 1710 aa33.96■■■■□ 3.03
TTLL5-216ENST00000556685 OSCARQ8IYS5 282 aa33.94■■■■□ 3.02
TTLL5-216ENST00000556685 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.93■■■■□ 3.02
TTLL5-216ENST00000556685 SYNJ2O15056 1496 aa33.93■■■■□ 3.02
TTLL5-216ENST00000556685 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
TTLL5-216ENST00000556685 ADAMTS12P58397 1594 aa33.89■■■■□ 3.02
TTLL5-216ENST00000556685 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.85■■■■□ 3.01
TTLL5-216ENST00000556685 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.83■■■■□ 3.01
TTLL5-216ENST00000556685 IGF1RP08069 1367 aa33.8■■■■□ 3
TTLL5-216ENST00000556685 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.77■■■■□ 3
TTLL5-216ENST00000556685 GRIN2AQ12879 1464 aa33.75■■■□□ 2.99
TTLL5-216ENST00000556685 CUL7Q14999 1698 aa33.72■■■□□ 2.99
TTLL5-216ENST00000556685 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.63■■■□□ 2.97
TTLL5-216ENST00000556685 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.58■■■□□ 2.97
TTLL5-216ENST00000556685 CEP170Q5SW79 1584 aa33.56■■■□□ 2.96
TTLL5-216ENST00000556685 NUP160Q12769 1436 aa33.56■■■□□ 2.96
TTLL5-216ENST00000556685 EEA1Q15075 1411 aa33.51■■■□□ 2.95
TTLL5-216ENST00000556685 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.47■■■□□ 2.95
TTLL5-216ENST00000556685 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.45■■■□□ 2.95
TTLL5-216ENST00000556685 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.43■■■□□ 2.94
TTLL5-216ENST00000556685 ARHGEF11O15085 1522 aa33.41■■■□□ 2.94
TTLL5-216ENST00000556685 PRXQ9BXM0 1461 aa33.39■■■□□ 2.94
TTLL5-216ENST00000556685 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99 ms