RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522368.5

RRM2B-208, Transcript of ribonucleotide reductase regulatory TP53 inducible subunit M2B, human

TSL 2

Gene RRM2B, Length 1,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM2B-208	ENST00000522368	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		45.83	■■■■■ 4.93
RRM2B-208	ENST00000522368	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		40.19	■■■■■ 4.02
RRM2B-208	ENST00000522368	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	38.48	■■■■□ 3.75
RRM2B-208	ENST00000522368	ABCC9	O60706	1549 aa		38.03	■■■■□ 3.68
RRM2B-208	ENST00000522368	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		37.98	■■■■□ 3.67
RRM2B-208	ENST00000522368	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		37.68	■■■■□ 3.62
RRM2B-208	ENST00000522368	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		37.64	■■■■□ 3.62
RRM2B-208	ENST00000522368	NACAD	O15069	1562 aa		37.44	■■■■□ 3.58
RRM2B-208	ENST00000522368	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		37.16	■■■■□ 3.54
RRM2B-208	ENST00000522368	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		37	■■■■□ 3.51
RRM2B-208	ENST00000522368	SCRIB	Q14160	1630 aa		36.78	■■■■□ 3.48
RRM2B-208	ENST00000522368	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		36.44	■■■■□ 3.42
RRM2B-208	ENST00000522368	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		36.05	■■■■□ 3.36
RRM2B-208	ENST00000522368	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	35.74	■■■■□ 3.31
RRM2B-208	ENST00000522368	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		35.57	■■■■□ 3.29
RRM2B-208	ENST00000522368	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	35.47	■■■■□ 3.27
RRM2B-208	ENST00000522368	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	35.42	■■■■□ 3.26
RRM2B-208	ENST00000522368	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	35.41	■■■■□ 3.26
RRM2B-208	ENST00000522368	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		35.37	■■■■□ 3.25
RRM2B-208	ENST00000522368	SMARCA4	P51532	1647 aa		35.31	■■■■□ 3.24
RRM2B-208	ENST00000522368	WIZ	O95785	1651 aa		35.08	■■■■□ 3.21
RRM2B-208	ENST00000522368	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	34.95	■■■■□ 3.19
RRM2B-208	ENST00000522368	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		34.95	■■■■□ 3.18
RRM2B-208	ENST00000522368	SMARCA2	P51531	1590 aa		34.76	■■■■□ 3.16
RRM2B-208	ENST00000522368	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		34.75	■■■■□ 3.15
RRM2B-208	ENST00000522368	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	34.75	■■■■□ 3.15
RRM2B-208	ENST00000522368	NCAPD3	P42695	1498 aa		34.52	■■■■□ 3.12
RRM2B-208	ENST00000522368	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	34.52	■■■■□ 3.12
RRM2B-208	ENST00000522368	HMGXB3	Q12766	1538 aa		34.49	■■■■□ 3.11
RRM2B-208	ENST00000522368	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		34.49	■■■■□ 3.11
RRM2B-208	ENST00000522368	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		34.33	■■■■□ 3.09
RRM2B-208	ENST00000522368	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		33.91	■■■■□ 3.02
RRM2B-208	ENST00000522368	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		33.72	■■■□□ 2.99
RRM2B-208	ENST00000522368	CFTR	P13569	1480 aa		33.67	■■■□□ 2.98
RRM2B-208	ENST00000522368	PRDM2	Q13029	1718 aa		33.6	■■■□□ 2.97
RRM2B-208	ENST00000522368	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		33.57	■■■□□ 2.96
RRM2B-208	ENST00000522368	ABCC8	Q09428	1581 aa		33.5	■■■□□ 2.95
RRM2B-208	ENST00000522368	TRIM41	Q8WV44	630 aa		33.42	■■■□□ 2.94
RRM2B-208	ENST00000522368	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		33.42	■■■□□ 2.94
RRM2B-208	ENST00000522368	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	33.34	■■■□□ 2.93
RRM2B-208	ENST00000522368	NES	P48681	1621 aa		33.32	■■■□□ 2.93
RRM2B-208	ENST00000522368	SYNJ1	O43426	1573 aa		33.24	■■■□□ 2.91
RRM2B-208	ENST00000522368	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		33.21	■■■□□ 2.91
RRM2B-208	ENST00000522368	TOP2B	Q02880	1626 aa		33.16	■■■□□ 2.9
RRM2B-208	ENST00000522368	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		33.16	■■■□□ 2.9
RRM2B-208	ENST00000522368	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		33.1	■■■□□ 2.89
RRM2B-208	ENST00000522368	CUX1	P39880	1505 aa		33.09	■■■□□ 2.89
RRM2B-208	ENST00000522368	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		33.04	■■■□□ 2.88
RRM2B-208	ENST00000522368	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		33.01	■■■□□ 2.87
RRM2B-208	ENST00000522368	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		32.91	■■■□□ 2.86
RRM2B-208	ENST00000522368	TOPBP1	Q92547	1522 aa		32.84	■■■□□ 2.85
RRM2B-208	ENST00000522368	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
RRM2B-208	ENST00000522368	SOGA1	O94964	1423 aa		32.8	■■■□□ 2.84
RRM2B-208	ENST00000522368	EEA1	Q15075	1411 aa		32.78	■■■□□ 2.84
RRM2B-208	ENST00000522368	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		32.76	■■■□□ 2.83
RRM2B-208	ENST00000522368	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
RRM2B-208	ENST00000522368	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		32.71	■■■□□ 2.83
RRM2B-208	ENST00000522368	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		32.69	■■■□□ 2.82
RRM2B-208	ENST00000522368	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
RRM2B-208	ENST00000522368	ERCC6	Q03468	1493 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RRM2B-208	ENST00000522368	WDR62	O43379	1518 aa		32.58	■■■□□ 2.81
RRM2B-208	ENST00000522368	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
RRM2B-208	ENST00000522368	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		32.53	■■■□□ 2.8
RRM2B-208	ENST00000522368	KIF27	Q86VH2	1401 aa		32.52	■■■□□ 2.8
RRM2B-208	ENST00000522368	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.51	■■■□□ 2.8
RRM2B-208	ENST00000522368	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		32.5	■■■□□ 2.79
RRM2B-208	ENST00000522368	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		32.49	■■■□□ 2.79
RRM2B-208	ENST00000522368	WDR97	A6NE52	1622 aa		32.49	■■■□□ 2.79
RRM2B-208	ENST00000522368	CUX2	O14529	1486 aa		32.47	■■■□□ 2.79
RRM2B-208	ENST00000522368	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
RRM2B-208	ENST00000522368	KIF21B	O75037	1637 aa		32.39	■■■□□ 2.78
RRM2B-208	ENST00000522368	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		32.3	■■■□□ 2.76
RRM2B-208	ENST00000522368	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32.28	■■■□□ 2.76
RRM2B-208	ENST00000522368	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.28	■■■□□ 2.76
RRM2B-208	ENST00000522368	PRX	Q9BXM0	1461 aa		32.27	■■■□□ 2.76
RRM2B-208	ENST00000522368	IGF1R	P08069	1367 aa		32.24	■■■□□ 2.75
RRM2B-208	ENST00000522368	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		32.22	■■■□□ 2.75
RRM2B-208	ENST00000522368	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		32.18	■■■□□ 2.74
RRM2B-208	ENST00000522368	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74
RRM2B-208	ENST00000522368	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		32.17	■■■□□ 2.74
RRM2B-208	ENST00000522368	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		32.16	■■■□□ 2.74
RRM2B-208	ENST00000522368	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		32.12	■■■□□ 2.73
RRM2B-208	ENST00000522368	CUL7	Q14999	1698 aa		32.11	■■■□□ 2.73
RRM2B-208	ENST00000522368	PBRM1	Q86U86	1689 aa		32.08	■■■□□ 2.73
RRM2B-208	ENST00000522368	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		32.06	■■■□□ 2.72
RRM2B-208	ENST00000522368	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
RRM2B-208	ENST00000522368	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.03	■■■□□ 2.72
RRM2B-208	ENST00000522368	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
RRM2B-208	ENST00000522368	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.71
RRM2B-208	ENST00000522368	GRIN2B	Q13224	1484 aa		31.98	■■■□□ 2.71
RRM2B-208	ENST00000522368	CEP162	Q5TB80	1403 aa		31.9	■■■□□ 2.7
RRM2B-208	ENST00000522368	ADAMTS12	P58397	1594 aa		31.87	■■■□□ 2.69
RRM2B-208	ENST00000522368	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RRM2B-208	ENST00000522368	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RRM2B-208	ENST00000522368	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
RRM2B-208	ENST00000522368	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		31.73	■■■□□ 2.67
RRM2B-208	ENST00000522368	CLIP1	P30622	1438 aa		31.72	■■■□□ 2.67
RRM2B-208	ENST00000522368	SYNJ2	O15056	1496 aa		31.62	■■■□□ 2.65
RRM2B-208	ENST00000522368	GRIN2A	Q12879	1464 aa		31.59	■■■□□ 2.65
RRM2B-208	ENST00000522368	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		31.51	■■■□□ 2.63

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