Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PHLDA2Q53GA4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHLDA2Q53GA4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHLDA2Q53GA4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHLDA2Q53GA4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHLDA2Q53GA4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHLDA2Q53GA4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHLDA2Q53GA4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHLDA2Q53GA4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHLDA2Q53GA4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHLDA2Q53GA4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHLDA2Q53GA4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHLDA2Q53GA4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHLDA2Q53GA4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHLDA2Q53GA4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHLDA2Q53GA4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHLDA2Q53GA4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHLDA2Q53GA4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHLDA2Q53GA4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHLDA2Q53GA4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHLDA2Q53GA4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHLDA2Q53GA4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHLDA2Q53GA4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHLDA2Q53GA4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHLDA2Q53GA4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHLDA2Q53GA4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHLDA2Q53GA4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHLDA2Q53GA4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHLDA2Q53GA4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHLDA2Q53GA4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHLDA2Q53GA4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHLDA2Q53GA4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHLDA2Q53GA4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHLDA2Q53GA4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHLDA2Q53GA4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHLDA2Q53GA4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHLDA2Q53GA4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHLDA2Q53GA4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHLDA2Q53GA4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHLDA2Q53GA4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHLDA2Q53GA4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHLDA2Q53GA4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHLDA2Q53GA4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHLDA2Q53GA4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHLDA2Q53GA4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHLDA2Q53GA4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHLDA2Q53GA4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHLDA2Q53GA4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHLDA2Q53GA4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PHLDA2Q53GA4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms