Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHLDA2Q53GA4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHLDA2Q53GA4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHLDA2Q53GA4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHLDA2Q53GA4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHLDA2Q53GA4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHLDA2Q53GA4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PHLDA2Q53GA4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHLDA2Q53GA4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHLDA2Q53GA4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHLDA2Q53GA4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHLDA2Q53GA4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHLDA2Q53GA4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHLDA2Q53GA4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHLDA2Q53GA4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHLDA2Q53GA4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PHLDA2Q53GA4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHLDA2Q53GA4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHLDA2Q53GA4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHLDA2Q53GA4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHLDA2Q53GA4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHLDA2Q53GA4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHLDA2Q53GA4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PHLDA2Q53GA4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHLDA2Q53GA4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHLDA2Q53GA4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHLDA2Q53GA4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHLDA2Q53GA4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHLDA2Q53GA4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHLDA2Q53GA4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHLDA2Q53GA4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHLDA2Q53GA4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHLDA2Q53GA4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHLDA2Q53GA4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHLDA2Q53GA4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHLDA2Q53GA4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHLDA2Q53GA4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHLDA2Q53GA4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHLDA2Q53GA4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHLDA2Q53GA4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHLDA2Q53GA4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHLDA2Q53GA4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHLDA2Q53GA4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHLDA2Q53GA4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHLDA2Q53GA4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHLDA2Q53GA4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHLDA2Q53GA4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHLDA2Q53GA4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHLDA2Q53GA4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHLDA2Q53GA4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHLDA2Q53GA4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHLDA2Q53GA4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHLDA2Q53GA4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHLDA2Q53GA4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PHLDA2Q53GA4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHLDA2Q53GA4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHLDA2Q53GA4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHLDA2Q53GA4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHLDA2Q53GA4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHLDA2Q53GA4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHLDA2Q53GA4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHLDA2Q53GA4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHLDA2Q53GA4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHLDA2Q53GA4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHLDA2Q53GA4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHLDA2Q53GA4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHLDA2Q53GA4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHLDA2Q53GA4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHLDA2Q53GA4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHLDA2Q53GA4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHLDA2Q53GA4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHLDA2Q53GA4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHLDA2Q53GA4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHLDA2Q53GA4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHLDA2Q53GA4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHLDA2Q53GA4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHLDA2Q53GA4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHLDA2Q53GA4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHLDA2Q53GA4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHLDA2Q53GA4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHLDA2Q53GA4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHLDA2Q53GA4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHLDA2Q53GA4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHLDA2Q53GA4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHLDA2Q53GA4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHLDA2Q53GA4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHLDA2Q53GA4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHLDA2Q53GA4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHLDA2Q53GA4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHLDA2Q53GA4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHLDA2Q53GA4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHLDA2Q53GA4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHLDA2Q53GA4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PHLDA2Q53GA4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHLDA2Q53GA4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHLDA2Q53GA4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHLDA2Q53GA4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHLDA2Q53GA4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHLDA2Q53GA4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHLDA2Q53GA4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms