Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCCQ00597 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCCQ00597 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCCQ00597 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FANCCQ00597 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FANCCQ00597 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FANCCQ00597 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FANCCQ00597 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FANCCQ00597 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FANCCQ00597 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FANCCQ00597 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FANCCQ00597 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FANCCQ00597 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FANCCQ00597 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FANCCQ00597 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FANCCQ00597 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCCQ00597 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCCQ00597 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCCQ00597 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCCQ00597 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCCQ00597 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCCQ00597 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCCQ00597 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCCQ00597 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCCQ00597 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCCQ00597 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCCQ00597 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCCQ00597 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCCQ00597 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FANCCQ00597 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCCQ00597 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCCQ00597 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCCQ00597 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FANCCQ00597 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FANCCQ00597 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FANCCQ00597 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FANCCQ00597 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FANCCQ00597 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
FANCCQ00597 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FANCCQ00597 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FANCCQ00597 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FANCCQ00597 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FANCCQ00597 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FANCCQ00597 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FANCCQ00597 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FANCCQ00597 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FANCCQ00597 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FANCCQ00597 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FANCCQ00597 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FANCCQ00597 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FANCCQ00597 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FANCCQ00597 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FANCCQ00597 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FANCCQ00597 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCCQ00597 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCCQ00597 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCCQ00597 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCCQ00597 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FANCCQ00597 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FANCCQ00597 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FANCCQ00597 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FANCCQ00597 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FANCCQ00597 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FANCCQ00597 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FANCCQ00597 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FANCCQ00597 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FANCCQ00597 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCCQ00597 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCCQ00597 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCCQ00597 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCCQ00597 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCCQ00597 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCCQ00597 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCCQ00597 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FANCCQ00597 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCCQ00597 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCCQ00597 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCCQ00597 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCCQ00597 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCCQ00597 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCCQ00597 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCCQ00597 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCCQ00597 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCCQ00597 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCCQ00597 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCCQ00597 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCCQ00597 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCCQ00597 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCCQ00597 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCCQ00597 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCCQ00597 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCCQ00597 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCCQ00597 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCCQ00597 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCCQ00597 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCCQ00597 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCCQ00597 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FANCCQ00597 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FANCCQ00597 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
FANCCQ00597 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms