Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNB1P98172 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNB1P98172 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNB1P98172 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNB1P98172 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNB1P98172 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNB1P98172 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNB1P98172 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNB1P98172 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNB1P98172 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNB1P98172 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFNB1P98172 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFNB1P98172 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EFNB1P98172 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFNB1P98172 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFNB1P98172 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNB1P98172 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNB1P98172 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNB1P98172 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNB1P98172 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNB1P98172 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNB1P98172 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNB1P98172 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNB1P98172 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNB1P98172 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFNB1P98172 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFNB1P98172 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFNB1P98172 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNB1P98172 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNB1P98172 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNB1P98172 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNB1P98172 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNB1P98172 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNB1P98172 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNB1P98172 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNB1P98172 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNB1P98172 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFNB1P98172 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFNB1P98172 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFNB1P98172 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFNB1P98172 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNB1P98172 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNB1P98172 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNB1P98172 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNB1P98172 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNB1P98172 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNB1P98172 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNB1P98172 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNB1P98172 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNB1P98172 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNB1P98172 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNB1P98172 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNB1P98172 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNB1P98172 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNB1P98172 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNB1P98172 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNB1P98172 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNB1P98172 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNB1P98172 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNB1P98172 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNB1P98172 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNB1P98172 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNB1P98172 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNB1P98172 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNB1P98172 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNB1P98172 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNB1P98172 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNB1P98172 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNB1P98172 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNB1P98172 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNB1P98172 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNB1P98172 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNB1P98172 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNB1P98172 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNB1P98172 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNB1P98172 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNB1P98172 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNB1P98172 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNB1P98172 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNB1P98172 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNB1P98172 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNB1P98172 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNB1P98172 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFNB1P98172 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFNB1P98172 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFNB1P98172 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFNB1P98172 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFNB1P98172 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EFNB1P98172 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
EFNB1P98172 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFNB1P98172 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms