Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NUCB2P80303 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NUCB2P80303 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NUCB2P80303 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NUCB2P80303 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NUCB2P80303 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NUCB2P80303 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NUCB2P80303 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NUCB2P80303 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NUCB2P80303 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NUCB2P80303 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NUCB2P80303 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NUCB2P80303 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NUCB2P80303 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NUCB2P80303 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NUCB2P80303 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NUCB2P80303 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NUCB2P80303 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NUCB2P80303 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NUCB2P80303 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NUCB2P80303 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NUCB2P80303 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NUCB2P80303 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NUCB2P80303 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
NUCB2P80303 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NUCB2P80303 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NUCB2P80303 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NUCB2P80303 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NUCB2P80303 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NUCB2P80303 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NUCB2P80303 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NUCB2P80303 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NUCB2P80303 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NUCB2P80303 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NUCB2P80303 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NUCB2P80303 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NUCB2P80303 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUCB2P80303 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUCB2P80303 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUCB2P80303 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUCB2P80303 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NUCB2P80303 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NUCB2P80303 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NUCB2P80303 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUCB2P80303 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUCB2P80303 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUCB2P80303 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUCB2P80303 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUCB2P80303 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUCB2P80303 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUCB2P80303 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUCB2P80303 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUCB2P80303 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NUCB2P80303 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NUCB2P80303 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NUCB2P80303 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUCB2P80303 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUCB2P80303 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUCB2P80303 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUCB2P80303 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUCB2P80303 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUCB2P80303 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUCB2P80303 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUCB2P80303 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUCB2P80303 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUCB2P80303 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUCB2P80303 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NUCB2P80303 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NUCB2P80303 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NUCB2P80303 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NUCB2P80303 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
NUCB2P80303 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
NUCB2P80303 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUCB2P80303 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUCB2P80303 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUCB2P80303 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUCB2P80303 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUCB2P80303 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUCB2P80303 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUCB2P80303 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUCB2P80303 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
NUCB2P80303 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUCB2P80303 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUCB2P80303 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUCB2P80303 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUCB2P80303 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUCB2P80303 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUCB2P80303 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUCB2P80303 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUCB2P80303 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUCB2P80303 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUCB2P80303 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUCB2P80303 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUCB2P80303 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUCB2P80303 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUCB2P80303 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUCB2P80303 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUCB2P80303 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUCB2P80303 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUCB2P80303 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms