Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NUCB2P80303 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
NUCB2P80303 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39.13■■■■□ 3.86
NUCB2P80303 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
NUCB2P80303 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.47■■■■□ 3.75
NUCB2P80303 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
NUCB2P80303 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
NUCB2P80303 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
NUCB2P80303 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
NUCB2P80303 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NUCB2P80303 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NUCB2P80303 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.62
NUCB2P80303 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
NUCB2P80303 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
NUCB2P80303 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
NUCB2P80303 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NUCB2P80303 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NUCB2P80303 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NUCB2P80303 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NUCB2P80303 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NUCB2P80303 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NUCB2P80303 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NUCB2P80303 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NUCB2P80303 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NUCB2P80303 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NUCB2P80303 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NUCB2P80303 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NUCB2P80303 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NUCB2P80303 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NUCB2P80303 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NUCB2P80303 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NUCB2P80303 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NUCB2P80303 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NUCB2P80303 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NUCB2P80303 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NUCB2P80303 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NUCB2P80303 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NUCB2P80303 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NUCB2P80303 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
NUCB2P80303 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NUCB2P80303 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NUCB2P80303 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NUCB2P80303 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NUCB2P80303 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NUCB2P80303 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NUCB2P80303 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NUCB2P80303 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NUCB2P80303 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NUCB2P80303 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NUCB2P80303 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NUCB2P80303 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NUCB2P80303 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NUCB2P80303 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NUCB2P80303 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NUCB2P80303 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NUCB2P80303 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NUCB2P80303 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NUCB2P80303 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NUCB2P80303 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NUCB2P80303 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NUCB2P80303 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NUCB2P80303 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
NUCB2P80303 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NUCB2P80303 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NUCB2P80303 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NUCB2P80303 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NUCB2P80303 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NUCB2P80303 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NUCB2P80303 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUCB2P80303 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUCB2P80303 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NUCB2P80303 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NUCB2P80303 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NUCB2P80303 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NUCB2P80303 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NUCB2P80303 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NUCB2P80303 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NUCB2P80303 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NUCB2P80303 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NUCB2P80303 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NUCB2P80303 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NUCB2P80303 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NUCB2P80303 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NUCB2P80303 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NUCB2P80303 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NUCB2P80303 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NUCB2P80303 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NUCB2P80303 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NUCB2P80303 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NUCB2P80303 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NUCB2P80303 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
NUCB2P80303 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUCB2P80303 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NUCB2P80303 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NUCB2P80303 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NUCB2P80303 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
NUCB2P80303 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NUCB2P80303 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NUCB2P80303 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NUCB2P80303 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms